自成化年間開始，陸續有人建議修改曆法，但建議者不是被治罪，便是以“古法未可輕變”、“祖製不可改”為由遭拒。
萬曆三十八年十一月日食，司天監再次預報錯誤。朝廷遂決定由徐光啟與傳教士等共同譯西法，供修改曆法時參考，但不久又不了了之。
朝廷不了了之，徐光啟卻還惦記著此事。
現在，兵器火藥局等工作，已被他的弟子，以及其他能人所承擔。他便上奏請開設曆局，重修曆法。
對於什麽祖製、古法，朱由校哪會當回事兒。既然曆法不準，那就重修改過來唄！
提筆批閱，朱由校允準徐光啟所奏。沉思了半晌，少年皇帝又給徐光啟寫了一份較長的批示，或者說是解釋。
金尼閣帶來的書籍非常多，除了朱由校指定的十幾本外，徐光啟和傳教士們還準備翻譯另外的一些。
這其中，就有丹麥天文學家第穀·布拉赫的學說。
不可否認，第穀所做的觀測精度之高，是同時代的人望塵莫及的。他所編製的一部恒星表相當準確，後世仍然具有價值。
但他的宇宙觀卻是錯誤的，他認為所有行星都繞太陽運動，而太陽率領眾行星繞地球運動。而這一體係在十七世紀初傳入我國，曾一度被接受。
而哥白尼雖然出版了《天體運行論》，但日心說在當時並沒有樹立起絕對的權威，爭議很大。
所以，曆史上的《崇禎曆書》認為第穀體係才是正確的，天文用表均以第穀體係為基礎進行編算，也引用了大量第穀的觀測資料。
朱由校作出指示，是覺得既然要動用人力、花費金錢和時間來編曆書，那就盡量一次弄得最好最科學。否則，不是有浪費之嫌嘛？
別以為朱由校是狗拿耗子管閑事，在封建社會，學天文習曆書可是統治者相當禁忌的事情。