溫體仁知道崇禎皇帝最恨有人造反，這一塊是他的逆鱗，觸之即死，是以便唆使手下，一頂造反的大帽子扣了下去，隻盼通過打擊孫元化，來實現打擊周延儒的目的。
這時隻見禦史餘應桂挺身而出，說道：“臣餘應桂，彈劾登萊巡撫孫元化，山東巡撫餘大成，有負天恩，枉顧職守，致使孔有德叛亂，禍亂山東，危害社稷，首輔周延儒收受孫元化人參，貂皮賄賂，舉薦孫元化，也負有失察之責，也應一並處分。”
兵科給事中李夢辰也站出附議，說道：“孔有德造反，一路殺官破縣，何以對孫元化另眼相看，輕輕放回，此必是孫元化與孔有德早有勾結，圖謀造反，皇上不可不察。”
又有禦史路振飛出列，稟道：“皇上，山東如今糜爛一片，山東巡撫餘大成，登萊巡撫孫元化兩人乃是罪魁禍首，其罪當誅，又有首輔周延儒，包庇二人，意圖開脫，也應一並獲罪，嚴加責罰。”
周延儒氣得渾身發抖，但是他一向涵養甚好，過了片刻，平息了一下心情，這才出列說道：“皇上，臣從未接受過孫元化任何賄賂，臣之所以力保孫元化，也非想要包庇於他，實在是孫元化人才難得，當初寧遠一戰，轟死老奴努爾哈赤的火炮，就是元化帶人建造，其人精通火炮，擅長鑄炮，火炮技術，在我大明無人能出其右。”
停了停，他又繼續說道：“孫元化從師於徐光啟徐大人，孫元化為人如何，徐大人想必是最清楚不過的。”
禮部尚書徐光啟此時也在場，此時他年歲已老，今年剛好七十歲，德高望重，深受崇禎皇帝信賴，聽聞周延儒提到自己的愛徒孫元化，心忖這次是躲不過去了，當即也顫巍巍地出列說道：“皇上，老臣有話要說。”
徐光啟曆經萬曆，天啟，崇禎三任皇帝，堪稱三朝元老，便是崇禎也不能不給他個麵子，當即便溫言說道：“老大人有話請講。”