十七世紀初期，正當大明土地兼並日益嚴重、貪腐橫行、內鬥不止、國勢江河日下時，歐陸各國正通過殖民擴張，瘋狂掠奪，逐步走向富強。
這一時期，最初的兩大殖民強國西班牙和葡萄牙正逐步喪失海上霸權，新興的海上強國荷蘭正逐漸崛起，為了在遠東進行殖民擴張，壟斷東方貿易，荷蘭於1602年成立了具有國家職能的荷蘭東印度公司，開啟了對遠東地區的殖民掠奪。
1604年，荷蘭東印度公司便派遣韋麻郎率領三艘戰艦占領澎湖馬公島，並役使當地人民“伐木築舍，為久居計”，意圖以此為殖民據點，壟斷大明與歐陸的貿易。
大明福建總兵施德政令福建都司都指揮使沈有容率兵當麵責問，荷方理屈，於當年十一月退出澎湖。
1622年，荷蘭東印度公司再次派出七艘戰艦外加九百餘名戰士，占領澎湖，並封鎖漳州出海口，使得大明水師無法出港，大明朝廷聞訊，隨即命令福建巡撫南居益組織水師將荷蘭人趕出澎湖
天啟四年二月，南居益親自乘船抵達金門，下令明軍渡海出擊，收複澎湖，總兵俞谘皋、守備王夢熊，率戰艦兩百餘艘，水師官兵一萬餘名，登陸澎湖，與荷蘭殖民者接戰。
但是，由於荷蘭殖民者在島上建築了堅固的工事，再加上他們的堅船利炮，明軍久攻不下。
天啟四年七月，南居益令福建都司沿海各衛所調集福船戰艦前往支援，開始對澎湖的荷蘭殖民者發動總攻。
天啟四年八月，明軍兵分三路，直逼荷蘭殖民者在澎湖修築的城堡，荷蘭殖民者終於不敵撤離，守將高文律等十二人被明軍生擒。
經此一役，大明收複了澎湖各島，荷蘭殖民者被迫撤往東番，歐陸列強見識了大明水師的厲害，後麵十餘年都沒再敢打大明的主意。
但是，由於明軍沒有乘勝追擊將荷蘭殖民者徹底趕出東南海域，以致荷蘭東印度公司在東番站穩腳跟，逐漸壟斷了大明、東瀛、朝鮮和歐陸的貿易，並勾結海盜，肆意劫掠各國商船，最終導致大明與荷蘭爆發了一場堪比鴉片戰爭的大戰。