朱由崧的禦營人馬雖然不多，但卻兵種卻是齊全的，有步兵，有騎兵，有輕重火器營和弓弩手，另外還有工兵營。
朱由崧當初讓劉肇基訓練的這一複合兵種能功能守，可以與韃子野戰，也可以攻堅，攻堅的手段之一便是動用工兵營爆破，這六百人朱由崧不能白養著他們，現在是啟用他們的時候了。
工兵營包括工程兵和爆破兵，炸藥和火炮應用於軍事，讓工程兵和爆破兵有了用武之地。
城中的清軍連吃敗仗，士氣低靡，如驚弓之鳥。隻要能把九江城炸開一個缺口，堅城優勢就喪失了，朱由崧的人馬能攻入城中，問題就解決了。
朱由崧立即與工兵營、輜重營、輕火器和馬步營以及水師營的統領研究具體的爆破方案，因為工兵營要完成爆破作業，須得這由這幾個營掩護協助。
兩天後的深夜，數條小船悄悄地從江中逆流而上，然後沿著九江護城河向前劃行，一直到九江南門外小舟才靠岸停下，船上裝的是炸藥，還有風幹的柴草，另外是鍬鎬，再就是工兵營的將士了。
夜幕下數條黑影帶著各自的應用之物棄舟上岸就爬到了城下。為了穩妥起見，這六百人在南城外選了三個爆破點，工程兵和爆破兵結合，每二百人負責一個爆破點。
九江城城高三丈五，城外的護城河又寬又深，城上的氣死風燈發出昏黃的光，夜深人靜，距離又高，守城的兵將和巡城的兵將一時竟然沒發現他們。
不過接下來麻煩來了。工程兵要首先開始作業了，必須得在城牆下麵打洞，然後由爆破兵把炸藥放進去，這才能算完功，如果把炸藥簡單地堆到城下，對這麽厚重堅固的城牆來說，這樣爆破一點把握都沒有，清圖浪費炸藥。
盡管工程兵受過這方麵的訓練，但挖土鑿石不可能沒有響動，這是一個大工程，三下五除二完工不了，最快也得半個小時左右。