崖州城北臨寧遠河，隻設有東西南三道城門。而城內靠北邊的這片區域，被百姓們稱為“官城”，即崖州各個衙門和地方官員居所的所在地。明朝的地方官僚體係基本是按照“三司”來分配，即承宣布政使司、都指揮使司、提刑按察使司，這三司分管行政、軍事、司法的職能，通過分權的方式來限製地方官的權力。崖州雖然隻是個小地方，但這三權分立的體係同樣是有完整的設置。
崖州的行政司法體係簡單來說，主要官員有從五品知州一人，作為二把手的從六品同知以及掌管司法治安的從七品通判數人，管理吏員的從九品的吏目一人，負責教育係統的儒學學正一人、訓導三人。當然，下屬的各縣還有各自的知縣、縣丞、主簿等低級官員職位設置。
而崖州的軍事體係的情況，要比行政司法體係複雜得多。大概是大明兵部從未考慮過崖州這小地方的戰時軍事指揮係統該如何協調，崖州駐軍的軍事長官僅僅隻是一名指揮僉事，下轄兩個千戶所的人員編製。這也是沒辦法的事情，整個瓊州府的衛所駐軍最高長官才隻是與參將等級相當的指揮使，下轄十一個千戶所——當然這也僅僅是紙麵數據而已，實際的兵員數目遠遠達不到編製的要求。這就帶來了一個問題，真到了打仗的時候，原本崖州水寨應該聽崖州城的調遣，但崖州城駐軍長官僅僅是個僉事，比水寨參將低了足足兩級，這就像上校要指揮少將作戰一樣荒謬，而由此將會帶來的指揮係統混亂似乎就是不可避免的事情了。
雖然這位駐軍最高長官隻是四品的僉事，不過待遇上比官職三品的崖州水寨何文輝何參將還稍好一些——畢竟手下有一兩千人的編製，就算是吃空餉屯私田，這油水也比水寨豐厚得多。當然對工作組來說，貪官肯定比清官好打交道，這位僉事大人有一些小毛病，對工作組在崖州的活動反而是一件好事。