陸軍第二混成協始建於徐世昌擔任東三省總督的時候，乃是從北洋二、四兩鎮抽調人手組建的部隊。也許按照徐世昌當初的意圖，是要在關外再組建一個北洋體係的。
不過隨著慈禧去世，攝政王載濤對於北洋的忌憚，自徐世昌調回京城擔任郵傳部尚書之後，仿照北洋體係組建的東北新軍就陷入了停滯，新上任的東三省總督開始扶植東北的巡防營以對抗這些原北洋六鎮抽調到東北的新軍了。
於是第一、二混成協隻能保持住現在的規模，而不能如當初徐世昌設想的那樣，以此為核心組建東北新軍的兩鎮。且陸軍一協原本應該有4038人的編製，但是因為不受重視，第二混成協幾乎缺額四分之一，隻有3362人。
失去了朝廷的信任，又被巡防營拿走了保境安民的職責，第二混成協上下也就失去了當初在北洋係統之內的那股精神，開始變得自由散漫了起來。雖說有北洋六鎮的稱號，但是北洋第一鎮乃是以旗人為主的朝廷嫡係，隻有第2、3、4、5、6鎮才是北洋集團的核心。
而第2、4、6鎮又是最初組建的三隻北洋常備軍，他們的裝備一向都是最新最好的，剩下不用的武器才會發給第3、5兩鎮。因此從第2、4兩鎮抽調官兵組建的第二混成協原本應該是真正的精銳才是。但是由於失去了朝廷的信任和不知為何而戰，這隻北洋精銳的精氣神很快就跨掉了。
有門路的軍官找人調回了關內，沒有門路的軍官則跟著藍天蔚學習起了革命理論來了。隻是藍天蔚雖然在湖北新軍時被日本教官稱讚為：學識優長，深得人心，有輔佐才能，無驕傲惡習，這種優秀少壯軍官，就是在日本軍隊中，也實不可多得。
但是他擔任第二混成協統製還不足一年，還不足以令整個第二混成協上下徹底改頭換麵。此外袁世凱招募兵丁時，特別挑選的無不良嗜好的河北農家子弟，同湖北新軍中大批不滿朝廷的知識分子是完全不同的兩類人。