1912 年7 月26 日，袁世凱不顧議會反對，出動軍警威脅參議院同意陸征祥出任國務總理。麵對袁世凱的專權，原本在唐紹儀內閣任農林總長的宋教仁，深感必須組織一個強大的政黨，造成兩黨通過競選輪流執政的製度，以把國家引向憲政軌道。
當時，南北小黨共有數百家之多，其中統一共和黨是參議院中的另一大黨，極其不滿陸征祥組閣，深感有擴大力量的必要，提出與同盟會合並的願望。經幾次商談後，合並之事進展頗為順利，國民公黨也表示願意加入合並，國民共進會、共和實進會得知三黨將合並，也表示願加入合並談判。
於是，統一共和黨、同盟會、國民公黨、國民共進會、共和實進會五個政黨合並，改稱“國民黨”。8 月25 日，在北京虎坊橋湖廣會館召開了國民黨成立大會。這一天正是孫中山來到北京的第二天。在會議選舉中，孫中山以1130 票的絕對多數，當選為理事長。孫中山力辭不就，於是，國民黨中央決定讓宋教仁代理。
袁世凱害怕他騙到手的權力被宋教仁用合法的手段再拿回去。於是，他授意內閣總理趙秉鈞收買刺客，跟蹤宋教仁，伺機向他下手。
1913 年3 月20 日晚上，宋教仁趕赴上海車站，打算坐火車去南京時被刺殺。
宋教仁被害的殘酷現實，使孫中山認清了袁世凱的猙獰麵目。他意識到，袁世凱就是共和民國的最大威脅，不打倒他，中國就會重新走回專製獨裁的黑暗時代。
因此，孫中山急忙從日本趕回國，召集同誌商議發動反袁的“二次革命”。從此，孫中山走上了捍衛共和民國的鬥爭曆程。
1913 年秋，孫中山決心要締造一個組織堅強的中華革命黨。但是，孫中山的誓詞，遭到了幾位老同盟會中堅人物的反對。
對於孫中山以武力討伐袁世凱的正確主張，國民黨的上層領導開始並不支持。不少人軟弱退讓，遲疑不決。這一點被袁世凱看透，他的氣焰更加囂張起來，悍然下令把一批國民黨官員，如江西省都督李烈鈞、安徽省都督柏文蔚、廣東省都督胡漢民等給罷了官，並派兵向南方的國民黨人發起武裝進攻。大勢所迫，國民黨人不得不起來應戰。