1618年天空中又先後出現了三顆彗星，伽利略身體狀況不佳，甚至都沒有用他的望遠鏡看上一眼。這時，正逢奧地利國王來意大利訪問，自然少不了要拜訪伽利略。伽利略在病榻上給裏奧波講述了一些彗星的理論，並說他早有意做進一步的研究。
這之後，伽利略聽到格拉西神父一篇有關彗星的公開講演，其中參考了大量伽利略研究的最近理論，但卻故意不提及伽利略的名字，使得伽利略十分生氣。
伽利略不假思索地對此舉表示不滿，他的弟子馬裏奧·圭杜奇帶了一篇格拉西的文章給他閱讀，使他更加忍耐不住，於是寫了一篇論文來陳述事實。
格拉西神父也寫了一篇論文來專門回應伽利略的攻擊，其中還帶有可能會造成巨大傷害的挑撥言辭，他說：“伽利略的門徒甚至沒有提到哥白尼的理論。是不是因為教會最近已宣告哥白尼之說屬非法，而伽利略就不再相信這一學說了呢？”他還指出伽利略的發現都是剽竊自別的科學家。
伽利略對一些值得信任的朋友說：“我敢回應格拉西的謊言嗎？針對剽竊的攻擊，我還可以很簡單的以幾句話澄清。但是，從羅馬回來以後，有關哥白尼學說的事我一直都很謹慎，沒有再寫過一句有關這個敏感問題的文字。但是，假如我現在宣稱我不信哥白尼——我絕不會這樣做——也隻會讓他更振振有詞地攻擊我。假如我完全不理會他的攻擊，那又會造成別人對我的誤解，好像我真犯了這罪過似的。”
商量的結果，出現了幾種不同意見，但有一點大家都同意：宗教戰爭（17世紀初，神聖羅馬帝國統轄下的德意誌地區各邦因為信仰不同和教產矛盾，分別組成新教聯盟和天主教聯盟。為了與對方抗衡，雙方都大力尋求外國勢力支持，於1618年到1648年爆發了大規模國際戰爭，又稱“宗教戰爭”——編者注）使得托斯卡納這個天主教派的城邦國民不敢對羅馬當局有任何反對意見，否則會帶來可怕的災難。馬丁路德的宗教改革已掀起了戰場上的屠殺，為了壓製基督教派勢力的擴張，羅馬天主教派必然極盡一切手段對外作戰，對內則清除一切異己分子和邪惡學說，以鏟除任何存在或潛伏的反對勢力。