現在，伽利略無法擺脫一種深切的沮喪感。他的實驗被學校當局視為虛偽的把戲，一個大學教授還玩球、做把戲，他把自己當成展覽會中的雜耍了嗎？因此，學校認為他不配擔任教職。
“亞裏士多德已經說過——”很多教授仍引用這句話來壓製學生們對斜塔實驗的報道。伽利略的一些朋友雖然相信他的實驗，卻不敢為他辯護。
穿著深色大袍的校長召見伽利略，再度斥責他的反叛。他宣布：“你犯了過錯，我們已經決定解聘你。你應聘到本校是來教授古哲真理，而不是妖言惑眾。我希望你早日離開這裏，以免造成更多的紛擾。”
伽利略反駁說：“你為什麽不說出我被解聘的真正原因呢？你不隻是為了我揭發亞裏士多德的錯誤，你以為我不知道喬凡尼王子想要把我毀掉嗎？”
“我不願屈尊和你爭論。”校長冷冷地回答，因為他知道，想否認這個在比薩盡人皆知的傳聞，隻是徒費口舌。
不久前，大公爵同父異母的兄弟喬凡尼曾派人來通知伽利略，說他的挖泥機模型已做好，希望伽利略來參觀一下。熟悉這位貴族發明家底細的人都警告伽利略說：“如果你想要批評他的話，你可要小心點。”
伽利略從來不知道什麽叫小心，可是他卻熟知名利二字的重要性，如果能讓這位美第奇家族的大人物高興，他就得到了一位有用的資助人。相反，如果惹怒了他，這個貴族發明家會變成一個危險的敵人。伽利略仔細檢查了那台機器模型，他實在沒有辦法說出一些虛假的奉承話，他直言相告，宣稱那台機器沒有價值。
喬凡尼勃然大怒，為了證明伽利略判斷失誤，他馬上下令，命人依照原設計模型製造出這種機器。機器製造完成後，喬凡尼才真正相信，這昂貴的發明的確是一件失敗品。王子羞憤難當，因此，他恨極了伽利略。他公開宣稱非要把伽利略趕離比薩大學不可。這次斜塔事件正好給了學校一個借口，以取悅這個比薩大學最大的資助人。