1767年9月間，利奧波德又帶著一家人來到維也納，一心希望再度成功。但是這一次，莫紮特沒有得到成功女神的眷顧，他失敗了！這是他的第一次失敗，但絕對不是最後一次。
當時，奧地利宮廷正在慶祝一位公主即將來臨的婚禮，利奧波德以為莫紮特一定會為這一盛會表演甚至作曲。不料，維也納卻爆發了天花，十六歲的準新娘因此病亡。
莫紮特一家人匆忙離開了維也納。利奧波德本來可以讓他的孩子們接種牛痘來預防天花，但這違背了當時普遍的宗教信仰。因為，當時認為人的生命是上帝給予的，上帝也有權力收回，特別是像莫紮特這樣奇跡般的孩子。
莫紮特和南妮爾都患了天花。莫紮特尤其嚴重，他的兩隻眼睛都被膿包覆蓋，一個星期看不見任何東西。所幸後來，莫紮特慢慢痊愈，視力也終於恢複。他在休養期間利用閑暇學習了玩牌和劍術，這後來成為他一生中的兩種嗜好。
莫紮特一家在1768年1月再度來到維也納。六年前那個漂亮可愛、被譽為神童的孩子現在已經不漂亮了，天花在他臉上留下了永久性的麻點，他已經不再讓人感到新鮮，而且十二歲的年齡嚴格意義上來講已經算是少年了。而且這個時候，瑪麗亞·特蕾西亞女王的丈夫弗蘭茨一世剛剛去世兩年半，宮廷仍在哀悼期間，貴族們對他已經不再有興趣，他們已經了解了他的才華，他不再具有轟動效應。與此同時，薩爾斯堡總主教因為利奧波德工作上長期的無所作為，已經停止了他的薪水。
瑪麗亞·特蕾西亞女王的兒子約瑟夫二世這時候與母親一同執掌奧地利王國，他指派莫紮特為宮廷歌劇院用意大利文寫一部喜劇歌劇。意大利文的喜劇歌劇當時在維也納極為流行，而大多數歌劇作家和音樂家都是意大利人。意大利喜劇歌劇以一般常見的人、事、物為特色，比如聰明的仆人叫愚笨的主人上當，好色的老翁企圖和美麗的少女結婚，假扮他人、認錯人、皆大歡喜的結局。它重點表現的是機智，以及能看得到的幽默。當然，作為歌劇的一個種類，它必須要有能夠唱得出的曲調。