“親愛的媽媽、爸爸，我現在在坎布裏奇，12小時之後，我將成為1904級的正式學生了！”1900年9月25日，富蘭克林在信上寫道。
富蘭克林的許多老同學也和他一樣進了哈佛。哈佛和格羅頓完全不同。格羅頓位於偏僻的鄉下，哈佛大學正好隔著查理士河與波士頓相對。在格羅頓，富蘭克林好像住在修道院，而在哈佛，他住在豪華的套房裏。在格羅頓，學生必須上學校安排好的每一門課，在哈佛，他們是選擇自己喜歡的科目！
大學第一年的課程——拉丁文、幾何、英文、曆史、法文和政治——根本不能滿足富蘭克林全部的精力和熱忱。許多課不對新生開放，但是他盡可能地多修一些課程。他還被錄取為《校旗報》的記者候選人，他花了許多時間來寫新聞報道，以期贏得在《校旗報》的地位。他有能力同時做許多事情，並且做得很好。
就在富蘭克林進入哈佛的前幾個星期，共和黨提名西奧多叔叔為副總統候選人。因此在到達哈佛後，富蘭克林立刻成為校內共和黨社團裏炙手可熱的人物，他也滿腔熱情地投入到總統競選活動之中。
當時，校園中時常流傳的問題是：哈佛校長會如何投票？查理斯·艾略特自1869年起擔任哈佛校長後，使哈佛成為了最傑出的大學之一。除了《校旗報》的主編外，一般人並不容易見到他。
初出茅廬的富蘭克林冒冒失失地跑去拜訪艾略特校長，問他會在大選中投誰的票。羅斯福進攻性地對校長說：“如果你的投票代表你的信仰，你就應該樂意把你的影響放在天平上。”艾略特回答了他的問題。《校旗報》刊登了富蘭克林的獨家消息，美國的其他大報紙也紛紛轉載了該消息。當富蘭克林快畢業時，他已經升為該報的主編。
年輕的羅斯福和父親及海倫·羅斯福坐船航行