1939年9月，第二次世界大戰爆發，起因是希特勒領導的裝甲部隊閃電突襲波蘭，英法對德宣戰，緊接著戰事迅速蔓延。
亨利對戰爭的看法仍和以前一樣，認為軍事上的勝利並不是真的勝利，不管英國、法國或德國也好，最後通通都可能是輸的一方。亨利也和過去一樣，不為英國、法國、德國製造武器，但允許設立在英國、加拿大、澳大利亞、南非、印度等地的福特工廠，為英國和法國提供武器援助，畢竟那裏的分公司曾經受到英、法兩國的保護，亨利這麽做也算是一種報答吧。
加拿大的福特公司是當時英國最大的汽車工廠，為了支援英國，那裏的工廠立即生產了五萬輛軍用車，在南非的分工廠所製造的軍用車也活躍在北非戰場上。亨利審時度勢，覺得美國參戰的可能性很大。為了保衛自己的國家，亨利決定再度從事軍械生產。
國防部最初向福特公司訂購了4000台引擎，要求是軍機用18汽缸、空冷式維特尼新型引擎，亨利立刻投資2000萬美元，建起了一座製造這種引擎的新工廠。生產這種引擎必需使用一種特殊合金，但目前還找不到製造這種合金的設備，福特公司又為此花了80萬美元，在盧其工廠建造提煉合金的熔爐。
除此之外，福特公司還為另外兩家公司提供零件，幫助他們製造轟炸機。後來美國軍方又改變了計劃，福特公司也被要求製造轟炸機。
福特公司還有一項很適合自己的任務，那就是生產吉普車。這種吉普車體型小、重量輕，又很堅固，爬坡力強，最高時速可達100千米，極適合執行偵察任務。車上可以裝載機關槍和三個士兵，無論是在泥土裏還是沙地上都能正常行駛。由於此車性能很好，陸軍單位就加倍訂購，福特公司為了供應軍方的需求，不停地生產這種被稱為“電擊汽車”的吉普車。