卻說光緒帝被李蓮英等一班內監蜂擁著到了瀛台，李蓮英說道：“請陛下在這裏稍待片刻，奴才還要侍候太後去哩。”說著便和內監等一哄的去了。當下光緒帝獨自坐在瀛台，聽候太後的旨意。
且說這天清晨，太後傳旨臨朝。殿上鍾鼓齊鳴，滿漢大臣紛紛入朝，猛見上麵坐的不是德宗皇上，卻換了西太後了，不覺齊齊的吃了一驚。正在摸不著頭腦，隻見西太後滿臉怒氣，厲聲問道：“皇上寵用康有為等，私下詔書，叫袁世凱秘密謀俺，你們眾臣可曾知道沒有？”這一問，嚇得滿漢大臣各低著頭，一句也不敢回奏。西太後便冷笑了一聲道：“虧你們食君之祿，忠君之事；卻都是這般屍位其職，連如此的大事也沒有得知，真是枉受爵祿之榮。將來怕咱們的江山給人占去了，你們也不曾覺察呢。”眾臣聽了西太後的責詰，都默默不語的十分慚愧。
正在這當兒，恰巧剛毅入奏，搜捕康黨事已了，主腦康有為、梁啟超二人已聞風逃脫，隻有譚嗣同、楊深秀、林旭、楊銳、劉光第、康廣仁等六人就獲。西太後見奏，傳旨將六人綁赴西市斬首。剛毅領旨，即傳侍衛等擁著六人望西市去了。可憐這六人便是世傳的“六君子”。這真是“功名未遂身先死，長使英雄淚滿襟！”後人有詞歎那六君子道：
滿清至斯國運剝，牝雞司晨家之索。囊昔武後是前車，婦人當國亡此祚！窮奢極欲世所稀，一朝平地風波起。車馬連夜馳入宮，警騎傳呼出禁中。昨夜猶草討賊檄，今朝成就冤臣獄。可憐刑曹頒懿旨，血染朝衣戮西市。忠魂夜夜泣黃沙，但願稚兒蒙恩赦。誰知君王尚不免，終身留得瀛台恨！嗟嗟！受戮六卿皆丈夫，甘為孤君擲頭顱。
西太後既斬了六君子，又命警騎追捕康梁，並頒詔通緝外；將朝諸臣，大大的偵查了一番。凡平素和康黨往來，或曾上折讚襄新政的，一概懲辦。當時被累及的大臣，革職的有陳寶箴、李嶽瑞、宋伯魯、吳懋鼎、張百熙、端方、徐建寅、徐仁鑄、徐仁鏡等。遣戍的有李端棻、張蔭桓等，監禁的有徐致靜、陳立三、江標、熊希齡等。逮捕抄家的有文廷式、王照、黃遵憲等。一時滿漢大臣，紛紛降調有差。又把懷塔布、剛毅、許應騤、曾廣漢、徐會灃等，重新起複原職，各加三級；趙舒翹擢入軍機處，授榮祿為軍機大臣，袁世凱擢山東巡撫，裕祿調署直隸總督，翁同和削去官爵。