晉元帝看見祖逖恢複了那麽多地盤，又如此得民心，於是下詔進封祖逖為鎮西將軍。
這時的祖逖，要滅了石勒，當然是很難的事；但是，石勒想擊敗祖逖，那也很艱難。
石勒不敢窺兵河南，於是，想出了和祖逖修好的法子，那就是派人去成皋縣，修祖逖母親的墳墓，同時寫了封信給祖逖，希望通使互市，讓趙晉能生意往來。
祖逖雖然沒有回書石勒，但是，任由互市，收利十倍。
這樣一來，不但百姓的日子好過，連地方士兵的日子也好過了，而祖逖的士兵和戰馬，一天比一天增多。
他的日子越來越好過，但他並沒有忘記當初擊楫中流的誓言，所以，他時刻想著攻打石勒，收複北方失地！
可惜，東晉的朝廷，已經不是皇帝說了算的朝廷了，而是王敦說了算。
祖逖聽聞王敦亂政之後，大為擔憂，很想領兵回去幫助皇帝，可是，他又考慮到自己一撤兵，石勒肯定攻打過來！
他這樣一左右為難，身體就漸漸有病了。
當時王敦打算進兵建康，處置朝臣，安插自己的親信。
祖逖知道後，聲色俱厲地對王敦使者說：“阿黑（王敦小名）怎敢如此放肆！你回去告訴他，讓他趕快滾回去。如果遲了，我就帶三千兵，溯江而上，趕他回去！”
王敦聽了，怕祖逖真的打過來，隻得打消了進兵建康的念頭。
這是祖逖平生第一次囂張地說話——直呼王敦為阿黑！
別人囂張一回，人們要為之側目；祖逖囂張一回，人們卻要為之鼓掌！
王敦，估計一輩子，也就隻有祖逖敢直接叫他阿黑！
祖逖看見國家內憂外患，自己又無能為力，就更加的憂憤了，病情也越來越嚴重。
他知道，自己恐怕時日無多了，當下下令把城牆壘得更堅固，免得為賊所襲。他派遣從子汝南太守祖濟率領汝陽太守張敞、新蔡內史周閎，率眾築壘。可惜，城牆未壘成，祖逖的病就更嚴重了。