司馬紹繼位之後，王敦再次舉兵攻打京師。
這時的王敦開始有病，王導不管王敦死沒死，率子弟們發哀，說王敦已死。
眾人聽聞，以為王敦死了，都有討伐錢鳳叛賊之誌。
晉明帝討伐王敦，便給王導調兵的節符，都督諸軍，領揚州刺史。
這一點，說明皇帝對王導是十足的信任。
後來，王敦之禍平息之後，王導進封始興郡公，邑三千戶，賜絹九千匹，進位太保，司徒如故，劍履上殿，入朝不趨，讚拜不名。
司馬紹年輕有為，而王導又善於治國。他們倆個聯手的話，晉朝會很快走向興盛。
可惜，司馬紹二十七歲，隻做了三年皇帝就死了。
他死前，遺詔王導和庾亮，共輔幼主，是為晉成帝。
這個庾亮是司馬紹的皇後庾文君的哥哥，也就是國舅了。
司馬紹這樣的安排，要是庾亮和王導是同一路人，那就沒什麽，要是不同一路人，內亂就此而起。
事實上，庾亮和王導果然不是同一路人。他一上台，就開始排擠王導。
王導麵對庾亮的排擠，他完全可以用實力反擊，但是，他沒有，他采取了忍讓的策略，避讓庾亮，也避免的朝廷的內鬥。
這個做法是正確的，因為，隻有這樣做，國家才會有凝聚力，外敵就不能乘亂而入。
不過，王導也不是什麽都忍讓，在大是大非，國家大決策上，不能做的，他寸步不讓。
庾亮想著讓自己權力更大，於是，要征曆陽內史蘇峻入朝，任命為司馬。實際上，就是要剝奪他手上的權力。
王導趕緊勸阻了，說：“蘇峻奸詐多疑，必定不肯奉詔前來。山川原野中，可以躲藏毒蟲猛獸，蘇峻在外，還不至於馬上發難，應暫時包容不驚動他為好！”
庾亮哪裏聽他的？隻想著擁有絕對大權，當下執意要征蘇峻入朝。