失了北疆之後，阿古柏令自己的二兒子海古拉守托克遜，馬人得守吐魯番，自己則退守距離托克遜八百裏外的喀喇沙爾，隨時準備逃跑。在托克遜、吐魯番、達阪這三個要塞之中，數達阪最為堅固，阿古柏在這裏也囤積了重兵。
由於在瑪納斯南城拖延了兩個月，秋去冬來，新疆地區也是大雪封山，江淮弟子不比當地的土著士兵，都耐不住寒冷，加之這一時間糧草比較缺乏，朝廷新派的金運昌部五千援兵也還沒有到。於是左宗棠下令軍隊休整，待來年春暖花開、冰雪消融之後再打。就這樣，經過了一冬的休整，光緒三年四月十四日，左宗棠下令清軍出擊。劉錦堂率部出烏城攻打達阪，張曜率部出哈密攻打七克騰木關隘。
兩天後，劉錦堂的部隊抵達達阪城外，此時天還沒有亮，城內守軍由於清軍長期休整，疏於防範，隻有城外壕溝裏不深不淺臥著的一潭死水算是個障礙。劉錦堂見溝裏水不深，但淤泥足以淹沒馬腿，隻能讓士兵裹了馬嘴，過泥淖，直抵城下。
待到天色大亮，城中士兵突然看到城外滿是清軍大旗，無不駭然，都奔走相告，軍心變得委靡不振。雙方很快就展開了火槍排射，互有傷亡。到了中午，劉錦堂騎馬繞城觀察敵情，被城內守軍認出，開槍射擊，槍彈打中了劉錦堂的戰馬和衛兵，劉錦堂卻絲毫不懼，換了一匹馬繼續觀察。
四月十八日，敵軍有小股援兵趕到，結果都被清軍剿滅。這天下午，城中溜出的百姓通風報信，說是城內守軍見援兵不至，想要突圍逃走。劉錦堂下令各營點起火把，防止敵人走脫。十九日，清軍在城外築起了炮台，對準達阪城一陣猛轟，其中一顆炮彈命中了城內軍火庫，引起了連環爆炸，一時之間達阪城變成了一片火海，守城官兵打開城門，混在百姓之中逃竄，清軍嚴守四門，結果總管愛伊德爾呼裏等一百多名敵軍將領悉數被捉住。這一仗擊殺敵軍兩千多人，俘獲一千三百人，槍炮利器更不在少數。