清廷與鄭氏集團之間的和平局麵一直維持到三藩之亂才被打破。
康熙皇帝撤藩令一下，康熙十二年(1673)八月，靖南王耿精忠即遣黃鏞到台灣，策動鄭經“速征帆同正今日疆土，仰冀會師共成萬古勳業”。鄭經得書大喜，立刻整頓船隻，調撥各屯屯佃歸伍分配。十月，鄭經率舟師到澎湖伺機進軍。吳三桂叛亂後，康熙皇帝停撤耿、尚兩藩，耿精忠馬上派黃鏞至澎湖，通知鄭經暫時按兵不動。
康熙十三年(1674)三月，耿精忠響應吳三桂舉兵反清，又遣黃鏞赴台，約請鄭經統率福建沿海戰艦，配合耿藩出師，從水陸兩路合力進攻江浙。鄭經當即部署陳永華留守台灣，命馮錫範督諸鎮船隻先行，隨後，自己統率大隊舟師進抵廈門。
同年四月，吳三桂派祝治國與劉定先送信至廈門，也請鄭經“速整貔貅，大引舟師，徑取金陵，或抵天津，斷其糧道，絕其咽喉”,並提醒鄭經這是“奇兵承虛，捷奏萬全”的策略。鄭經即遷副將陳文煥隨同祝治國、劉定先往湖廣聯絡吳三桂。表麵上耿、吳與鄭有著共同反清的目標。但是他們都以擴張自己的地盤與勢力為目的，由此引發出彼此之間的矛盾和衝突是不可調和的。
耿精忠起兵時，擔心漳、泉文武官員不服，不料起兵不到數日，而得全閩和漳、泉，這時，他很後悔約請鄭經渡海。同時，赴廈門去聯絡鄭經的定遠將軍劉炎的胞弟劉煜，目睹“廈門瓦爍滿地，茅草盈野，船隻散處停泊，寥居始創淒涼”,不由得頓生輕視鄭經的意念。劉煜返回後，向耿精忠報告說：“海上兵不滿二千，船不過百隻，安能濟事”。於是，耿精忠立刻通飭沿海邊界，照前禁例，嚴禁船隻下海，禁絕與鄭經往來。
鄭經見耿精忠突然變卦，速差遣禮官柯平趕到福州，麵責耿精忠言而無信。耿精忠直截了當地答複柯平：“你回去告訴你的主人，各地分守，毋作妄想。”柯平如實回報鄭經。鄭經勃然大怒，急令侍衛馮錫範、左武王劉國軒等率兵攻取同安、海澄，連下泉州、漳州。耿精忠即遣馮國銓至廈門麵見鄭經，索地請和，將沿海島嶼讓給鄭經，彼此不禁往來通商貿易。鄭經嗬斥耿精忠墨跡未幹，遂而背約。雙方關係十分緊張。