康熙十二年(1673)十二月二十一日，差往貴州備辦吳三桂撤藩事務的兵部待郎黨務禮、戶部員外郎薩穆哈，奏報了吳三桂的反叛詳情。消息傳來，舉朝上下為之震驚。盡管反叛並非一時一事釀成，但撤藩是導火索，人們的視線不可免避免地集中在撤藩之議，因而責怪倡義者是理所當然的。大學士索額圖力主將“前議三藩當遷者，皆宜正以國法”。康熙皇帝十分冷靜，斷然否定索額圖的意見，自己承擔了全部責任，他說“朕自少時，以三藩勢焰日熾，不可不撤，豈因吳三桂返叛遂諉過於人耶”,他力保主張撤藩者，諸臣對此“莫不感激涕零，心悅誠服”。
康熙皇帝意欲派遣八旗勁旅平定叛亂，但朝內出現分歧意見。漢官左僉都禦吏魏象樞反對自京發兵，說“聖人舞幹羽而有苗格,何必勞師於遠?賊至，我逸待勞，即可息弭矣。”滿族朝臣雖然在撤藩問題上意見分歧，但在派兵平叛上意見卻一致。他們當麵反駁說“賊逼城下始出兵禦敵，有是理乎”。漢大臣反對自京派兵，主要是擔心“軍需浩繁”,不勝負擔，所以建議“就近調兵禦守”。戶部尚書米思翰答道“賊勢猖獗，非綠營兵所能克製，宜以八旗勁旅會剿。軍需內外協濟，足支十年，可無他慮。”最後，康熙皇帝決定出兵平叛。
康熙皇帝力圖將戰事控製在雲南、貴州、湖廣(今湖南、湖北)三省之內。派前鋒統領碩岱率每佐領前鋒一名，兼程前往咽喉要地荊州(今湖北江陵)防守，以固軍民之心，並進據常德(今湖南常德),以遏製叛軍北進。接著，命西安將軍瓦爾喀率副都統一員，悉領騎士，選拔將領，星馳開赴四川，堅守自滇入川險隘之地，待大軍進剿雲南時與提督配合，相機進討。因廣西近鄰貴州，授孫延齡為撫蠻將軍，以線國安為都統，令統兵固守。為了集中力量打擊吳三桂，及時下令停撤耿、尚二藩，召回梁清標和陳一炳。