張居正死後遭到清算，名譽掃地，家破人亡。在此後的近40年裏，張居正就是邪惡的代名詞。
不過，萬曆皇帝死後不到3年，他的孫子就給張居正“平反”了。
當然，所謂平反在那個時代是常見的事，不足為奇。除了個別特殊情況外，多數被處理過的高級領導幹部最終會被平反。比如當年被嘉靖皇帝殺掉的首相夏言後來也平反了。無非是把剝奪的封號之類重新恢複，如此而已。平反不說明當時搞錯了，隻是後來的繼任者以此表示寬大、寬容和皇恩浩**。
那麽，清算張居正到底應不應該？清算什麽？如何清算？這一切，似乎都不是根據什麽是非標準，而是以權力、利益來考量的。
實際上，直到現在，對張居正的評價也還是沒有是非標準的。
以公平正義的曆史觀來考察，應該說，清算張居正是無可厚非的。至少，以高壓手段不允許別人說話，摧殘正直之士，甚至從肉體上消滅僅僅是提出不同意見的體製內外的人士是應該清算的。
張居正高壓統治的10年和對張居正的清算所帶來的有形、無形的影響，都是無可估量的。
盡管張居正沒有繼承他的前任高拱的改革路線，沒有致力於高拱孜孜以求的“立規模”——有可能推動轉型——的製度創新，但是也可以毫不含糊地說，張居正是有理想的領導人——激活建國初期創立的製度，實現偉大複興；也是幹實事的領導人——充盈空空如也的國庫，富國強兵。要集中力量辦大事，一定程度上的權力集中，有其必要性；為了實現自己的理想，不怕得罪人，敢於任事的勇氣，也有值得欽佩的一麵。而且，在他的領導下，國家機器高效運轉起來，確實幹了不少實事，在傳統政治的框架內，取得了令人矚目的成就。這10年，是穩定的10年，也是實現了國庫富足的10年。