嶽鍾琪得到曾靜書信後，即行奏報。雍正極力撫慰他，誇獎他的忠誠，說他朝夕焚香，對天祖叩首，祝願嶽鍾琪“多福多壽多男子”。並說他給嶽鍾琪的諭旨，都是真心話， “少有口心相異處，天祖必殛之”。對臣子起誓，如同昔日對待年羹堯一樣，表示對嶽鍾琪的絕對信任，目的是進一步把嶽鍾琪穩定住。
於是，雍正投入更大的精力處理曾靜案子。指令刑部侍郎杭奕祿、正白旗副都統覺羅海蘭到湖南，會同湘撫王國棟審理曾靜一幹人犯。曾靜供出他的思想受浙江呂留良的影響，張熙見過呂留良的弟子嚴鴻逵及再傳弟子沈再寬，因是廣泛株連。後因涉及人多，地域廣，為加速審理進度，將案中人通通押往京城審訊。
雍正對曾靜投書一案的方針，在一開始就定下來了。他在雍正六年(1728)十月十七日的嶽鍾琪的奏折上批道：
朕覽逆書，驚訝墮淚。覽之，夢中亦未料天下有人如此論朕也，亦未料其逆情如此之大也。此等逆物，如此自首，非天而何?朕實感天祖之恩，吳天罔極矣。此書一無可隱諱處，事情明白後，朕另有諭。
他說自己受到莫大的冤枉，但卻是好事——正好洗刷冤情。他雖說料不到有人那樣議論他，其實，他實行的奏折製度，能很快獲得各種消息。他知道關於他的嗣位，處理允福黨人，誅戮年、隆，朝野頗多私議，隻是自己不便挑明，公開論戰，因而隱忍不發，或隻一般談談。如元年、二年兩次講到有人說他“淩逼弟輩”“淩逼眾阿哥”,僅表示那是攻擊，並不追究造言者。曾靜出來了，固然把他罵得狗血噴頭，但有人承認了這些言論，正好順藤摸瓜，清其源而塞其流。所以，雍正在上述朱批諭旨中指示嶽鍾琪“卿可將冤抑處，伊從何處聽聞，隨便再與言之，看伊如何論議”。這就是說他重點追查關於他的失德言論的根源。他的寵臣、雲貴廣西總督鄂爾泰在關於曾靜投書案的奏折中說：曾靜“誣謗聖躬”, “所以能如此，得如此者；臣以為其事有漸，其來有因” “若非由內而外，由滿而漢，誰能以影響全無之言據為可信，此阿其那、塞思黑等之本意，為逆賊曾靜之本說也”。雍正經分析認為民間的傳說，必來自官場，而本源必在皇室內部，具體來說就是允裸、允糖。雍正稱讚他的奏折“懇摯詳明，深誅奸逆之心”,他們君臣追造