1987年，高士其繼續在北京醫院住院治療。
1988年，高士其因病醫治無效，於12月19日逝世，享年84歲。
高士其的逝世，給他的夫人金愛娣帶來了巨大的悲痛。
高士其的靈堂前擺放著金愛娣自己題寫的挽聯：
今生成永訣
來世再結緣
“他沒有死，他還活著……他身體是熱的……”金愛娣趴在白床單上哀哀慟哭，怎麽也不相信這是事實。這位看上去已經白發蒼蒼的老婦人，其實才59歲！長年的勞累和疲乏，使她的大腦中樞神經嚴重失調，疾病也開始糾纏她，她經曆了四次大手術的折磨。尤其是最近一年多來，她照顧高士其，晝夜不停地吸痰、翻身和護理，每天堅持洗臉擦身。焦慮、壓抑、操勞的情緒，一直隨著高老的病情折磨著她的心。她三個月沒顧上洗澡。直到高士其燒退清醒之後，她才放心地去擦擦身子。她摸著像針紮一樣疼痛的胸口驚呆了，右乳竟長出了疙疙瘩瘩的小硬塊。她的一位搞醫務工作的朋友拿著化驗單心疼地責怪她說：“愛娣呀，真有你的，到這地步了，你怎麽不知道哇！”
乳癌手術後，她的淋巴腺上還留下大大小小的幾十個癌塊尚未完成治療，她又去照顧高士其。癌症病人的化療，使她頭暈、惡心，全身癱軟。為了照顧高士其，她多次停掉化療。按規程2年中應完成8次化療，而她隻做了4次。現在，癌細胞轉移，已呈晚期骨癌擴散。人們看著她憔悴的麵容，遲緩甚至有點蹣跚的步履，怎麽都難以把她與高士其夫人的身份聯係起來，更不相信她是位隻有59歲的人。在漫長的28年的時間裏，金愛娣“把妻子、妹妹、朋友、同誌和母親，總之，一個女人所能有的愛全部奉獻給了高士其，常常忘記了她自己”。此刻的金愛娣，頭發淩亂，形容枯槁，穿著一件後背有些開線的黑毛衣，噙著淚水，說話哽咽，樸實得像一個老保姆一樣，顯得格外清瘦、孤單。