1905年（1歲）
11月1日，出生於福建閩侯，今福州市。原名高仕，別名成瑤。高士其從小就受到良好的家庭教育。祖父高伯謹喜作詩文；父親高讚鼎曾任清朝外務部官員，亦擅長寫詩；母親何詠閣能寫一手好字。
1906年（2歲）
隨父母遷往蘇州，住倉米巷10號。
1908年（4歲）
弟弟仕登死於白喉，初步意識到病菌——“小魔王”的可怕。在祖父的教讀下，已經能夠背誦《千字文》、《三字經》和《幼學須知》等。
1910年（6歲）
患白喉，險些喪命，更加仇恨“小魔王”。同年遷回福州，住花巷4號。
1911年（7歲）
祖父教他讀《大學》，並給他講“格物、致知、誠意、正心、修身、齊家、治國、平天下”等儒家大道理。
1912年（9歲）
入福州北城小學二年級讀書。
1913年（9歲）
轉入明倫小學三年級就讀。
1914年（10歲）
初小畢業。
1918年（14歲）
高小畢業，考取北京清華留美預備學校。8月到北京參加考試，因成績優良，被編入清華留美預備學校初中二年級。入學不久，父親調北平工作，舉家遷往北平。
1919年（15歲）
“五四”運動爆發，高士其與同學一起寫標語、印傳單、上街遊行，參加愛國活動。5月4日，在遊行中任小隊長，帶頭高喊“打倒列強！”“抵製日貨！”“打倒軍閥！”“取消21條！”等口號。
1920年（16歲）
參加青年會和萬國童子軍通訊社。在清華園參加世界基督教學生會議。
1921年（17歲）
寒假到沈陽參加華北運動會。同年初等科（初中）畢業，升入高等科（高中）。
1922年（18歲）
寒假去濟南、泰山、青島等地旅遊。
1923年（19歲）
主動參加山東省華洋賑災工作和修路工作，並當英文翻譯，直接看到了農民生活的痛苦和農村社會的真麵貌。暑假，申請到山東膠濟鐵路四方工廠實習三個月，回校後，用英文寫了兩篇論文：《膠濟鐵路四方工廠調查記》和《中國鐵路的現在和將來》。前者獲“周年紀念獎”，後者獲“林鈞紀念獎”。秋季，參加秋令營。