學校開設的博物課，也就是我們今天說的生物課，主要講述動物、植物和微生物的有關知識。通過博物課，高士其不僅了解了很多新知識，而且對老師講解的如何製作植物標本很感興趣，自己就動手做了很多有關樹葉、花瓣等的標本。到後來上解剖課時，高士其也不像別的同學那樣膽小，敢於自己動手，在老師的指導下，做解剖豚鼠的實驗。如果說植物學、動物學的知識還不是十分陌生的話，微生物學則是全新的領域，許許多多肉眼看不見的微生物世界，在顯微鏡下一一暴露無遺，這讓高士其感到非常新鮮有趣。當他通過顯微鏡看到那些形形色色的小東西——微生物時，他像哥倫布發現了新大陸似的，高興地大叫起來：“嗬，‘小魔王’原來是這個樣子！”高士其把那些微生物認作奪去他大弟生命的病菌了。
老師耐心地對高士其說：你看到的還不是“小魔王”。世界上的植物有30多萬種，動物有120多萬種，而微生物更多，有200多萬種，又被分作五大類：細菌、放線菌、酵母菌、黴菌和病毒，而每一類，又可以再細分。致人死亡的白喉杆菌，隻是細菌的一種。高士其沒有想到，看不見的微生物世界還這麽複雜，就充滿好奇地問老師：“那白喉杆菌又是什麽樣的呢？”
有一天，生物老師將高士其叫到實驗室，把顯微鏡交給他，說：“你能看到些什麽？”高士其通過顯微鏡認真觀察起來，他告訴老師，他看見一些長長的、瘦瘦的，像火柴杆兒那樣的小東西。老師說：“這就是奪去你大弟生命的‘小魔王’——白喉杆菌。”高士其死死盯著這些害人的“小魔王”，仿佛要把它的形象刻在腦子裏似的，準備隨時親手消滅它。從此，高士其對顯微鏡有了特殊的感情，一有空，就到實驗室，用顯微鏡觀察各種微生物的形態與變化，與“小人國”結下了終生之緣。