東亞模式取得了令人矚目的經濟發展成就，但這種模式的弊端也是顯而易見的，這主要表現在以下三方麵：
一是經濟快速發展必然導致“蘿卜（賣得）快了不洗泥”。意思是說，發展速度太快了經濟質量就容易下降，以至於形成泡沫經濟。
二是東亞模式過於依賴外部市場和國際資本。不用說，你的經濟發展快了、別國經濟相對慢了，就容易引起國與國之間的經濟和政治衝突，從而帶來不良影響，這也是1998年爆發亞洲金融危機的根源之一。
三是東亞模式容易在國內造成經濟不平衡，從而帶來經濟衰退。一方麵是，政府主導型市場經濟容易阻礙市場機製充分發揮作用，扭曲市場；另一方麵是，過於偏重外向型經濟、對國際市場依賴性太強，國外經濟的泡沫破滅時就會出現所謂外需不足導致的國內經濟衰退；與此同時，雁行經濟形態本身也會加劇區域經濟發展的不平衡。為此，韓國就推出了一種新的發展模式即國家均衡發展戰略，並且成立國家均衡發展委員會來主抓這件事，以遏止貧富差距擴大、產業競爭力下降等問題。