隨著政治形勢的變化，到1964年，仍然堅守在唯心主義陣地的熊十力，已經徹底地陷入孤獨的境地，登門的人極少，寫成的新書《存齋隨筆》也沒有地方出版。
更糟心的是，這年春夏之交，熊十力又生了一場大病，住了很久的醫院。他出院後在家靜養，但是身體狀況再也沒有恢複到之前的狀態。12月份，病體尚未痊愈的熊十力接到通知，要到北京出席全國政協四屆一次會議，列席三屆全國人大第一次會議。盡管身體虛弱，已到80歲高齡，但是，熊十力還是欣然登上了北上的列車。
人大會議開幕的那天，熊十力本來是應該前往人民大會堂列席會議的，但是，由於嚴重的神經衰弱，害怕電光刺激，經請假後，他未到大會堂聽會，而是在住地研讀周恩來總理的《政府工作報告》。
對周恩來總理，熊十力有著深厚的感情。早在重慶的時候，周恩來為了把一批知名的人士團結在中國共產黨的周圍，經常去位於北碚的勉仁書院看望熊十力和梁漱溟等人。經過深入交談，熊十力對周恩來的印象極好，建立了良好的私人關係，熊十力也經常回訪拜見周恩來。當時，北碚離重慶八路軍辦事處比較遠，路又不好走，熊十力便向國民政府的大員、自己的老朋友居正借用汽車，專程前去拜見周恩來。回到北碚後，他逢人就說：“周先生很厚道，平易近人，智慧過人，是個大好人！”
全國解放後，周恩來擔任政務院總理，對熊十力關懷有加。每次開政協會議，見到熊十力也總是噓寒問暖。據說有一次散會後，因為人多車多，熊十力一時找不到自己該上去的那輛專車，便生氣地大罵“王八蛋”，責怪司機和後勤人員不負責任。正罵著，恰好周恩來從禮堂裏走了出來，見熊十力一臉怒氣，忙上前詢問原委。知道來龍去脈後，周恩來勸道：“熊先生，不要生氣，我叫人派車把您送到住地就是了。”經這一勸，熊十力感到自己有些過火，同時也感到周恩來的可親。