唐慎微出身世醫之家，祖上都是行醫之人，他在這樣的環境裏長大，耳濡目染，自小就對醫學有著深厚的興趣。雖然他其貌不揚，舉止木訥敦厚，為人不善言辭，但內心卻極為聰慧，心地善良純厚。在家人的教誨下，他刻苦學習醫學，由於他的聰穎勤奮，逐漸學會了醫學的精髓，掌握了高超的醫術，尤其是對經方深有研究。
青年時期的唐慎微，在學習之餘，經常出去給病人看病，這使得他的醫術造詣更得以飛速進展，由於他的醫術高超，不久他就成為當地的名醫。唐慎微對待病人一視同仁，凡是上門來求醫問藥者，無論是達官顯貴還是平民百姓，在他眼裏都是他的病人，從無高低貴賤之分。精湛的醫術，加上高尚的醫德，使他的聲名遠播各地。盡管如此，他仍然好學不倦。宋哲宗元祐年間（1086—1093年），他應曾經師承儒學大家程頤、程顥的蜀帥李端伯邀請，前往成都行醫，暫時居住在成都府東南郊的華陽，後來遷居到了成都。
在成都行醫期間，無論是在寒冷的冬季，酷熱的夏天，刮風下雨，還是白天黑夜，他都是有招必往。他對待病人，認真辨症，仔細地望聞問切，經過他的精心治療，病人都康複得很快，因此廣受讚譽，人們都稱讚唐慎微治病“百無一失”。他和其他醫生不同的是，從不向病人索取診金財物報酬，隻求病人及其親朋好友以其抄寫的效方良藥知識為酬。因此人們都願意與他接近，把所知好方良藥告訴他。即使從經史諸書中發現的醫藥知識，也必寫、抄錄下來告訴給他。
當時，成都華陽地方有位叫做宇文邦彥的名士患了嚴重的風毒病，請遍了成都的名醫，名醫們都束手無策，找不出方法來治愈他的病。這時，就有人推薦了唐慎微。經過唐慎微一診察，沒想到竟然手到病除。僅僅服藥數劑就緩解了病情。在唐慎微的精心治療下，宇文邦彥的病很快痊愈。可是，唐慎微斷定這種病輕易是不斷根的，如果身體稍弱這種病就會複發的，於是他就親筆寫了一封信，封好交給了宇文邦彥的兒子，並在信封上注明要等到某年某月某日才可以開封。到了這個日子，宇文邦彥的風毒之病果然再次發作。按唐慎微的囑咐，宇文邦彥的兒子打開了封存已久的信件，隻見上麵寫著三個方子：第一個方治療風毒再作，第二個方治療風毒攻注作瘡瘍，第三個方治風毒上攻、氣促欲作咳嗽。結果按方治療，半個月病就痊愈了。這件事傳遍了成都，當時人們都叫他神醫。