事實上，人們對於腦白金的質疑，是圍繞“褪黑素”展開的。
在《南方周末》的《腦白金真相調查》中，首先闡明了“腦白金”是什麽的問題。該文引用腦白金說明書中的話：人體的司令部是大腦，大腦的總司令部是大腦中央的Pinealgland(部分說明書稱為“腦白金體”)。其分泌物為腦白金，它控製著人體的衰老程度。
攻擊腦白金的人發出這樣的疑問，大腦中是否真的有“腦白金”和“腦白金體”？然後筆鋒一轉，說到目前為止找不到任何正規的學術文獻證實確實存在這兩樣東西，它們隻是大腦中“鬆果體”和其分泌的“褪黑素”的對應物。
也就是說，腦白金是史玉柱和健特公司給鬆果體和褪黑素取的別名。
可以說，史玉柱打了一個擦邊球，因為《腦白金真相調查》說了一大堆，還是沒有提出有利的證據證明腦白金的確產生了一定的毒副作用，或者腦白金一點安眠的成分都沒有。
但有一點必須承認，在保健品的銷售過程中，由於總部施壓，下麵分支機構的銷售人員為了保證銷量，的確會授意：說明書和廣告詞打得越吸引人越好。
反對腦白金的人提出了自己的證據，而史玉柱打造腦白金，也是有他的證據的——即一本名為《褪黑激素的奇跡》的書。這本書，甚至在記者采訪他的時候，還在他手邊放著，堪稱是腦白金的“經典”。這本書本來是美國人寫的，後被台灣人翻譯，輾轉到了史玉柱手裏。
這本書的作者之一，是醫學及哲學博士華特·皮爾鮑爾利。他做過一項實驗，給10隻老年鼠和10隻小鼠做了顯微鏡外科手術，把它們的鬆果體互換。過了一段時間，老年鼠變得活力十足，皮毛有光澤，還厚實。而小鼠卻垂垂老矣，步履蹣跚，患上了白內障。屍體解剖結果顯示：小鼠的胸腺全部萎縮，而老年鼠的部分胸腺卻從萎縮狀態恢複了。