解放前夕，胡適曾為邵洵美定了兩張赴台機票，但是，邵洵美以不忍離開家人，以及工廠無法處理為由婉謝。邵洵美的朋友、國民黨外交部長葉公超得悉後，說服國民黨的海軍部門用軍艦帶邵家的人與機器一道遷台，邵洵美也謝絕了。主要原因是，此前好友羅隆基已向他細述了中共對待知識分子的政策，他相信自己以前的所作所為是有目共睹的，共產黨來了，他也會有出路的，因此他靜等上海解放。
不幸的是，邵洵美在1958年終因一封向項美麗索要借款的英文信，以“曆史反革命”罪名被逮捕審查。在監獄，邵洵美與因胡風案入獄的作家賈植芳成了“獄友”。邵洵美在放風時偷偷告訴賈：“賈兄，你比我年輕，你還可能出去，我不行了，等不到出去了。”他鄭重交代賈植芳，將來出來的話，有機會要為他寫篇文章幫他澄清兩件事，那就死而瞑目了。第一，1933年英國作家蕭伯納來上海，是以中國筆會的名義邀請的。邵洵美是世界筆會中國分會的秘書，蕭伯納不吃葷，吃素，他就在南京路上的“功德林”擺了一桌素菜，花了46塊銀圓，是邵洵美自己出的錢。因為世界筆會隻是個名義，並沒有經費。但是後來大小報紙報道，說蕭伯納來上海，吃飯的有蔡元培、宋慶齡、魯迅、林語堂……就是沒有寫他。他說：“你得幫我補寫聲明一下。還有一個事，就是魯迅先生聽信謠言，說我有錢，我的文章都不是我寫的，像清朝花錢買官一樣‘捐班’，是我雇人寫的。我的文章雖然寫得不好，但不是叫人代寫的，是我自己寫的。”賈植芳和邵洵美“同監”四個月，後來被調走。但他一直記著邵洵美在獄中叫他幫忙澄清兩件事。1989年賈植芳果然寫了篇文章登在《上海攤》雜誌上，算是踐約。
1962年4月，邵洵美被無罪釋放。隨後，厄運又降臨在他身上。備受淩辱之後，他悲痛欲絕，1968年5月5日，在醫院的他服藥結束了生命。1985年2月，邵洵美的“曆史反革命案”正式平反。