1908年11月14日，西太後整整一天都在處理國家事務，到了晚間才歇息，盡管非常辛苦，可這樣一來西太後反而氣色非常好。第二天，西太後依然如舊6點起床召見軍機大臣，和皇後、監國攝政王以及福晉(即榮祿女兒)談了很多話，還以皇帝的名義下達了一份諭旨，尊西太後為太皇太後，尊皇後為太後。當時就開始籌備慶祝尊號典禮，還要預定監國的大禮。到了中午，西太後剛剛吃飯，忽然間暈了過去，昏迷了很長時間。等清醒過來之後，眾人都說是因為前幾天過度勞累，導致舊病複發，病源在夏季的痢疾上，是那次得病傷了元氣導致的。西太後自己感覺時日無多，隨即召見光緒皇後、監國攝政王、軍機大臣，並下達諭旨，吩咐各項事務非常清楚，一如往日處理國事。諭旨內容是：
奉太皇太後懿旨：昨已降諭，以醇親王為監國攝政王，秉承予之訓示處理國事，現予病勢危急，自知不起，此後國政即完全交付監國攝政王。若有重要之事必須稟詢皇太後者，即由監國攝政王稟詢裁奪。
凡是了解宮廷情況和西太後的人，可以從上麵諭旨發現最後幾句話的重要性，其中的含義或許是想給新太後和葉赫那拉氏族機會，遇到有大事時候能參與。這樣，就能維持葉赫那拉氏永遠的權貴，進而鞏固當下的地位。假如監國攝政王和其他人有仇視的行為，那麽新太後就可以拿著這份諭旨說話。縱觀端方因為陵寢對新太後失敬後被立即罷免直隸總督職務的事情，就什麽都清楚了。從這裏可以知道監國攝政王職位的難做。隆裕太後使用特權，就是在給自己樹立威信。
西太後下達了上麵的諭旨後，病情開始不斷加重，就命令草擬遺詔，軍機大臣擬寫詔書後呈上。西太後審閱後，修改了很多地方，還添加了很多句子，即遺詔中“不得不再行訓政”那句話。西太後對眾人說到添加幾句話的意思：“我數次垂簾聽政，不知情者認為是貪權，實際情況是迫於形勢，不得不如此。”遺詔的末尾“回念五十年來……”也是西太後添加上去的，意思是回首一生沒有悔恨的意思。遺詔確定之後，西太後就開始向身邊的侍從訣別，周圍的人都在傷心。西太後神智非常清楚，盡管在彌留之際，依然在連續說話，和平時一樣，態度平和。後來，西太後漸漸昏迷，周圍侍從都說時辰到了，而此刻西太後忽然間又清醒了過來，在臨終前數分鍾依舊保持生的希望。掌控朝廷大權長達50年的西太後，留在人間的最後一句話竟然出人預料。她說：“今後，不允許婦人預聞朝政，這樣做違背祖宗家法，一定要嚴加限製，尤其要提防不可以讓宦官專權。明朝末年的事情須引以為戒。”說完，西太後去世，當時是下午3時，西太後麵向南方。或許，中國的傳統認為君王臨終都要麵向南方。有目擊者說：“西太後去世後，口張著沒有閉合。”有人就猜疑這是靈魂不願意離開身體的緣故。就這樣，權威至高無上的西太後歸天了！她的去世有點像其生前，也具有興奮勇曆的狀態，或許西太後本來就是一位深不可測的人物。接下來，小心入殮，隨後連同皇帝的遺體從西苑轉移到了禁中，途中都是叩頭的人。到達禁城之後，分別在大殿裏停靈。現在，將西太後遺詔——50年來最後的詔書記錄如下：