1645年（順治二年）正月，李自成、劉宗敏率部撤離西安，接著李過、高一功會同西北部分地區的大順軍也撤出陝西。清軍兩大主力分別在三月間由陝西轉入河南：多鐸部取道歸德南下進攻弘光朝廷；阿濟格部則緊追由李自成親自率領的大順軍主力。留在陝西的清軍力量自然相當單薄。於是，一些抗清武裝乘時而起，其中影響較大的有賀珍、武大定、孫守法等部。
賀珍原是大順軍舊部，當清朝重兵入陝、大順政權瓦解的時候，他夥同羅岱、黨孟安、郭登先以漢中之地投降清朝，由英親王阿濟格劄授漢中總兵。[34]陝北等地大順軍在李過、高一功、李友、田虎等率領下取道漢中入川時，他率部阻擊，被李過、高一功等奮力擊敗，兵馬損傷不少。接著在1645年六月左右，張獻忠派軍北攻漢中，賀珍又“詐稱大清兵威迎敵”，獻忠兵不知虛實，退回四川。[35]這年九月，清廷“以漢中投誠總兵賀珍禦賊有功，授為定西前將軍”[36]。然而，這隻是表麵文章，實際上對他卻是嚴密監視，處處提防。早在這年五月清陝西總督孟喬芳就在奏疏中說：“惟新招漢中賀珍、羅岱、黨孟安、郭登先四總兵，查得此輩原非明朝舊官，俱是流賊起手頭目。曩自敗遁盤踞漢中，臣屢發諭帖，示以我皇上威德，並陳之利害，方畏威投順，繳送偽印。羅岱親至西安，臣已調撥延安駐紮，與總兵薑瓖同居一城，以為鈐製；賀珍、郭登先亦調鳳翔，再為分撥；止留黨孟安統兵一萬仍住漢中，以為進剿張逆（指張獻忠）並防漢中城池。但四將俱係逆闖親信之人，恐狼子野心反複不定，俱在陝西深為不便。伏乞我皇上將賀珍、郭登先以有功名色升調宣大或山東一帶地方安置，實為解散之計也。黨類既散，總（縱）有叵測，亦無能為矣。”[37]