進取台灣，必先攻克台灣的門戶澎湖列島。施琅於康熙二十年（1681年）十月初六日風塵仆仆抵達福建廈門履任，這次對於台灣他是誌在必得，完成一樁未了的夙願。他仿佛回想起康熙三年（1664年）那次攻台失利的情形。那時的施琅剛剛背叛鄭成功，留在鄭營的父兄侄子全部被宰殺，所以這不僅僅是急於建功立業的問題，也是為了報仇雪恨。當然在家仇國恨的基礎上，最終他還是放棄了對於鄭氏家族的冤冤相報，為了國家和平統一，接受了鄭氏後人的投降，並向朝廷提出優待鄭氏後人的建議。
施琅其實並不是一個頭腦簡單四肢發達的一介武夫，他在少年時期就很有見識，不僅膂力過人，而且精通排陣布局的兵法，尤其善於水戰，諳曉海上風候具備氣象方麵的知識。明末追隨隆武帝在剿滅山中土匪有功，被授予遊擊將軍，曾經隸屬黃道周，而道周先生不能用他，辭職而去。去了鄭芝龍部，隨大軍投降清軍，立有大功。鄭成功設計誘捕將他關押在船中，他獨自脫逃，父親、弟弟、侄兒皆被殺。鄭成功後悔常常說，這又是一個楚國的伍子胥啊，帶有報仇雪恥的怨恨一定會前來報複的。[1]
當施琅被任命為福建水師提督總兵官，加靖海將軍頭銜，其實就已經踏上了報仇雪恨的路。此刻，施琅的水師官兵中大部分都是鄭軍水師投降而組建的海軍。如從鄭軍降清的承恩伯周全斌、太子少師左都督楊福，康熙一概信任有加，命他們統領水師“前往征剿”台灣。皇帝並告誡說：“凡事會議酌行，勿謂自知，罔聽眾言。”也就是凡是進軍大計必須經過總督、巡撫、提督會商後進行，這是明清時期在國防、軍政大計方麵“三權分立”相互製約的體製性規定。這次清廷第二次武力出征台灣，而且主要將領均為原來鄭軍海上投誠人員擔任。