1900年農曆五月二十六日，王道士偶然發現了一個秘密洞窟。這個石窟就是敦煌莫高窟。令唐史學家沒有想到的是，在敦煌殘卷中竟然透露出了黃巢死因的蛛絲馬跡。
敦煌文書裏有一件《肅州報告》黃巢戰敗等情況殘卷，寫道：其草賊黃巢被尚讓殺卻，於西川進頭。公元884年5月，黃巢在今河南中牟西，遭沙陀騎兵突襲，犧牲萬餘人。在此危急關頭，尚讓卻率萬人投降唐廷。
有推測，尚讓很可能在混戰之中將黃巢殺死。這個戰報被立即飛報朝廷和作戰軍隊，這一情節就被記載在《肅州報告黃巢戰敗等情況殘卷》中。
各類記載針鋒相對：或者黃巢逃過一劫？
唐代學者崔致遠所著的《桂苑筆耕錄》中記載的信息說明，唐將時溥是引誘黃巢起義軍當中投降的將領把黃巢殺死的。
令人疑惑的是，如果當時有人殺死黃巢，必定立下大功。即便是作為幫凶，其名字也會名揚四海，並為各種史書所記載。但關於尚讓殺黃巢的說法，在迄今發現的史料中的記載隻有一處。
在宋朝邵博的《河南邵氏聞見後錄》卷十七中曾經提到，若說殺黃巢於狼虎穀，獻首於徐州，兩地相距約五六百華裏，快馬也要三天路程，而徐州至成都馬不停蹄，日夜兼程，也需二十天。當時又值盛暑，“函首”恐怕早已腐臭不堪了，更何況黃巢兄弟六七人，難言其中就沒有與黃巢狀貌類似者。
如此看來，很有可能在狼虎穀中被林言殺死的隻是黃巢的替身。
宋人劉是之的《劉氏雜誌》中有這樣的記載，五代時有一個高僧法號翠微禪師，這個人就是黃巢。更為傳奇的是張端義在《貴耳集》中記載說，“黃巢後為緇徒，曾主大刹，禪道為叢林推重，臨入寂時，指腳下有黃巢兩字”。
在這些史料中，雖然黃巢起義軍在山東狼虎穀幾乎全軍覆沒，但此時黃巢並未身死，他用金蟬脫殼之計瞞過唐朝追兵的眼睛，在逃出狼虎穀的殘軍中依然有黃巢的身影。