世宗初立，召守仁入受封。而中有沮者，謂國甫大喪，不當宴賞，中道止之。拜南京兵部尚書，參讚機務，歸省。尋論封奉天翊衛推誠宣力守正文臣，特進光祿大夫、柱國、新建伯。父華亦得封如之。父病中膺封，卒。
初，宸濠之叛也，結譽士大夫，無所不傾下。守仁亦與無崖異，嚐使其門人冀元亨往觀之。宸濠自謂善守仁，密謀於陸完，意守仁得為其巡撫，用是其形跡不能無疑於士大夫。守仁憂居講學，受弟子，而忌者蜂起，頗目為偽學。至雲初通宸濠謀，策其不勝而背之，言絕醜，不可聞。以是雖封爵賜號，竟不與鐵券及歲祿，一時勤王有功諸臣，中傷廢斥殆盡，唯伍文定得升副都禦史，蔭一子千戶。守仁不勝憤，乃上疏再辭爵，且極論白諸有功者。溫旨慰諭，終格不行。守仁所善席書與門人方獻夫、黃綰，皆以議禮得幸上，交章守仁賢，宜大用，亦尼不果。
嘉靖五年，岑猛叛，詔兩廣聚兵討猛。猛死田州。其黨盧蘇、王受相結再叛，嶺南大困。桂文襄萼素不善守仁，為張璁所強，交口薦代姚鏌總督兩廣。守仁至，開示恩信，盧蘇、王受等自縛來歸，則悉遣其眾歸農七萬一千餘人，勒石誌功德。時八寨瑤賊反側嶺表，與斷藤峽、牛腸、六寺、仙台、花相諸瑤相煽結。守仁以便宜，密令故降蘇、受等輕兵出。而永樂、保靖士兵之自嶺南還者，亦過八寨，與蘇、受等相犄角，徑搗其巢，誅斬萬計，八寨盡平。捷聞，朝廷以其誇擅，敕獎而已。獻夫、韜言其功不可泯，上許條畫善後以聞。是時守仁已病矣，輿疾勞所事，而桂萼方長吏部，暴喜功名，風守仁取安南，希崇封。守仁辭不應，以是益怨守仁，讒守仁，賞不進。守仁病劇，乞骸骨，臥舟待命。甫度大庾嶺，卒，為七年之十一月。時白氣亙天，數日乃已。萼等因盛言守仁初擒宸濠，攻戰紀律不臧，奏捷多偽；又言擅離本職，處置田州事宜失當；學術不端，破壞士習；乞削奪官爵。詔免奪爵，停恤典，子不得嗣封。