對於好不容易拿下的小日本，朱顯波當然不願意輕易放棄了，加上各地的殘餘軍閥並沒有完全消失，朱顯波值得陸續派朝中大臣前往大阪、京都各地。對於很少有海外殖民經驗的大明朝廷來說，一個倔強的崛起中的日本是很難馴服的。
緊接著祖大壽被任命為日本總督，全權代理日本事務，出發之前，朱顯波特意將祖大壽召回京師當麵叮囑。
“祖愛卿，此番前去日本比你和袁崇煥將軍在遼東所麵臨的局麵還要更加複雜和困難，朕希望你多和當地大族搞好關係，同時時刻隱秘監控各地方勢力，對於岐阜、長濱。小田原等地的鐵炮鑄造所要嚴密監控，能撤的要下令撤掉。對於安東、江戶、房總等水軍能收編的收編，不能收編的要盡快遣散。”
“對於島津、伊達等大名要實行拉攏政策。特別要防範那些裏所的忍者，還有各地比較有實力的商人如島井宗室、角倉了以等要向他們做出相應的承諾，主要是保障商道通暢和稅賦穩定。實在不行，朕就將訓練幾年的特種部隊交給你一段時間，用於應付局麵。不過你要確保他們的安全，盡量減少傷亡的情況下，悄悄行動。”
“微臣明白。”
“還有將你外甥吳三桂一並帶去吧，也好有個幫手，你的家眷你自己安排，如果不能適應那邊的生活，就讓他們搬到京師來，朕派人照顧他們。”
“微臣謝皇上隆恩，臣已於賤內商議，臣一人前往日本，夫人攜四子留在朝鮮。”
“朝鮮也是荒蠻之地，還是搬到京師來吧，如果將來日本治安好轉了，你有十足的把握控製局麵了，商船直達的，你就和鄭泰等人商量下，讓他們母子多去看看你。”
“微臣謝皇上隆恩。”
祖大壽心裏其實很明白，如果自己一開始就提出來將家眷遷往日本，皇上不一定同意，更何況那邊環境複雜，剛剛臣服，皇上讓自己的妻兒進京也是為了更好的保護他們。畢竟小日本的忍者也不是吃素的。隻有等將來治安好轉了再做打算。畢竟要征服一個國家不是件容易得事情，何況是小日本，他們已經習慣了欺侮朝鮮、琉球甚至大明。