鯀禹聯盟和重黎聯盟是被掩藏得較深的兩組兩合婚姻聯盟，前者因兩族曾經存在的父子關係的個別案例而被誤認為是一種普遍恒定的父子關係，後者則因這兩個聯盟的融合而誤認為是一個神。這些誤論都有必要加以澄清。
就像炎黃聯盟出現了蚩尤這樣的異端勢力，顓頊帝嚳部裏也出現了一支反叛力量，這就是鯀部。鯀即共工，因為從語音上看，“鯀”與“共工”隻是聲音長短之別，古籍記載中有諸多證據說明他們是一人或關係密切的人，對此，前人已經有詳論。[26]《世本》：“顓頊產鯀。”《史記·夏本紀》：“鯀之父曰帝顓頊。”《山海經》郭注引古本《竹書紀年》：“顓頊產伯鯀。”這些清楚地說明，鯀出自顓頊族。
這一支分裂出去的氏族的反叛時間較蚩尤為長。顓頊當政時代，共工就與他爭帝，在堯舜時，鯀的反叛尚未止息。就像炎黃部聯合攻殺蚩尤一樣，堯舜聯合鎮壓了鯀。《國語·周語下》：“其在有虞，有崇伯鯀，播其**心，稱遂共工之過，堯用殛之於羽山。”“稱遂共工之過”，說明鯀與共工的承襲關係；既言有虞（舜）當政，又言堯殛鯀，除了說明舜與堯聯合執政外，更說明這場鎮壓是雙方聯手。古書或稱堯殛鯀，或稱舜殛鯀。《尚書·舜典》中說舜“殛鯀於羽山”。《呂氏春秋》則不言誰殺，但看起來還是舜，而有堯支持：
堯以天下讓舜。鯀為諸侯，怒於堯曰：“得天之道者為帝，得地之道者為三公。今我得地之道，而不以我為三公！”以堯為失論，欲得三公，怒甚猛獸，欲以為亂，比獸之角能以為城，舉其尾能以為施。召之不來，仿佯於野，以患帝舜。於是，殛之於羽山，付之以吳刀。[27]
總之，鯀部是遭重創了。據《尚書·舜典》，共工與鯀尚並存，他們是同族的兩支，都遭了舜的迫害。