紀曉嵐利用近一個月的時間刻意核校，查出潘檉章《國史考異》等應毀及語義可疑各書凡十餘種，經軍機處逐部詳細閱看，分為應行撤毀、刪削及毋庸議毀各項，開列清單如下：
一、《國史考異》係考訂明太祖、成祖兩朝國史之是非，其中引錢謙益之說甚多，而不著其名，且詞相連屬，難以刪削，應行銷毀。
二、《十六家詞》內紀昀所指鄒祗謨《滿江紅》詞一首辭意憤激，然並無謗訕之意，似可毋庸抽毀，惟書中有龔鼎孳所著全集業經銷毀，不複存此詞，應一律抽毀，改《十五家詞》。
三、朱彝尊《曝書亭集》並無違礙，惟紀昀指出《譚貞良墓表》內所稱“貞良百折不回，卒保其發膚首領，從君父於地下”等語，似有語病，應一律抽毀。
四、吳偉業《綏寇紀略》、陳鼎《東林列傳》二書，均無違礙，而內外之詞稱謂有乖體製，應一律改正。
五、黃虞稷《千頃堂書目》多列已毀之書，應行一律刪削。
六、姚之駰《元明事類鈔》、仇兆鼇《杜詩詳注》俱襲引錢謙益撰著而去其書名，應一律刪削。
七、朱鶴齡《愚庵小集》，紀昀所指《書元好問集後》一篇，意在痛詆錢謙益，持論未為失當，誠如聖諭，若於推許錢謙益者即經飭禁，而於詆訾錢謙益者複事苛求，未為允協。惟朱鶴齡未與錢謙益絕交之先，往來詩文有《贈某先生詩》等作，又箋注《李義山詩注》序內紅豆莊主人，皆係指錢謙益，應一律刪削，其全集仍應擬存。
八、吳綺《林蕙堂集》間有近於慨歎興亡之語，多係文人習套，並無謗訕，仍應擬存。
九、葉方藹《讀書齋偶存集》語無違礙，紀昀指出《南海子詩》“何當小住三千歲，再見桑田變滄海”二語，誠如聖如聖諭，此條文人套用語，仍應擬存。