隆科多作為機密重臣，所作所為更為雍正注意。隆科多在選任官員方麵握有大權，這本身就容易與雍正發生衝突。再加上隆科多專斷攬權，一手遮天，使得雍正開始猜忌他。
和年羹堯一樣，曾被雍正恩寵又稱之為舅舅的隆科多，下場也很悲慘。雍正鐵腕禦臣。隆科多最終被雍正監禁致死，未能善終。
雍正生性多疑，對臣子的一舉一動，都密切注視。隆科多作為機要重臣，所作所為更為雍正注意，隆科多在選任官員方麵握有大權，這本身就容易與雍正發生衝突，再加上隆科多專斷攬權，一手遮天，使得雍正開始猜忌他。在吏部，所有官員對隆科多都“莫敢仰視”，一切公事的處理全由隆科多做主，人們對他經辦的銓選，以其姓佟，專稱“佟選”，可見他的專權。
不僅如此，隆科多有很多方麵因權勢增大而開始不檢點。一次果郡王胤禮進宮，隆科多見了，站起來表示致敬。胤禮未看到，與他同行的領侍衛內大臣馬爾賽告訴了他，他便欠身而過。在康熙時，隆科多見到皇子都是跪一足請安，而這時對雍正的親信弟兄也隻是起立而已。對其他皇子的恭敬之情可想而知了。馬爾賽告訴胤禮隆科多起立致敬，意思是讓胤禮有所表示，以便討好隆科多。這種小事可見隆科多得勢之後的專橫和驕縱。
隆科多比年羹堯聰明之處在於他了解雍正的性格和做事方法，盡管如此他依舊沒有逃出雍正的手掌。
隆科多知道雍正的性格喜怒無常，預料臫的地位不會穩固，因而在許多事情上都留有後手。雍正好抄人之家，隆科多怕輪到自己頭上，早就把聚集的財產分散藏到各親友家和西山的寺廟裏。雍正明察秋毫，這件事不知怎麽又讓他知道了，因此更認定隆科多不守君臣大義。隆科多曾主動提出辭掉其步軍統領的兼職。當時年羹堯尚為雍正所寵信，雍正就這件事情對年羹堯說：“朕並未露一點，連風也不曾吹，是他自己的主意。”又說：“鞏泰近日與舅舅亦不甚親密”，想用他接替隆科多。選擇這樣的人來繼任步軍統領，分明是不讓隆科多再對這個職務發生任何影響。雍正說不是自己要讓隆科多辭職，這完全是欺人之談。隆科多一定是感覺到雍正對自己有所不滿，以辭職爭取主動以便脫身，由此看來隆科多比年羹堯有所克製，更明察事理。但以權謀私、擅作威福又使他同年羹堯一樣逃脫不了雍正的懲治。