雍正認為：科甲出身的人營私作弊，還不如用非科甲出身的人，因為前者狡詐隱秘，互相袒護，不易識破，而後者即使作弊也容易暴露出來。所以他表示一定要把官場中科甲人的“唐宋元明積染之習，盡行洗滌”。
謝濟世參劾田文鏡的事件，引起了雍正對科甲人結黨問題的重視，因此在處置謝濟世後，他就以“科甲”朋黨事，曉諭漢人中科舉出身的官員。他說，“你們這些漢人，出於同年和師生的關係，結黨成風。平時緊密地聯結在一起，有事時就互相袒護，拉關係，求人情，違背公家的利益，包庇私人。這種壞風氣，已愈來愈嚴重。”他嚴厲警告說，本朝選拔賢能不止一個來源，不像明朝以任用科目出身的人為唯一途徑，如果科目出身的人徇私結黨，互相排擠傾陷，一定要擾亂國政，肆行無忌，那麽“朕為紀綱法度，風俗人心之計，豈肯容若輩朋比妄行！必致盡斥科目而後已”，“即有議朕為不重科目者，朕亦有所不恤。”這裏，他明確提出了反對“科甲”朋黨的重大任務，並表示了不惜廢除科舉取士製度的堅強決心。雍正為什麽如此痛恨“科甲”朋黨呢？雍正認為：科甲出身的人營私作弊，還不如用非科甲出身的人，因為前者狡詐隱秘，互相袒護，不易識破，而後者即使作弊也容易暴露出來。所以他表示一定要把官場中科甲人的“唐宋元明積染之習，盡行洗滌”。雍正深知乎甲人的朋比黨援，是唐宋以來的千年積習，為害甚大，不清除不得了，因而再一次強調了反對“科甲”朋黨的任務。
由於雍正深知科甲習氣的巨大危害，因此他在用人時，特別注意其是否有這種陋習，並且在密折中時時以此警誡大臣。雍正六年十一月，他在廣東布政使王士俊的奏折上批示說：“第一滌除科甲袒護之習為要務！”雍正七年一月。在福建巡撫劉世明的折上朱批說：“趙國麟一片忠誠，人品端方，但恐不免科甲向來習氣，當留心細看。”同年二月給廣東巡撫傅泰的諭旨說：“陶正中、於其珣恐蹈科甲陋習，當留心試用。”同月楊鯉奏折朱批：“王驀乃一幹員，但慮其科甲習氣未除，……”同年四月給趙國麟的諭旨：“盡力屏去科甲朋比、因循委靡、袒護沽譽諸陋習，朕所教誨指示者，隻此一語而已。”