第二次鴉片戰爭時，俄人強迫清政府訂立璦琿條約（1858），將黑龍江以北、外興安嶺以南的60萬平方公裏土地割讓給俄國（僅瑗琿對岸江東64屯中國仍保留居住權，義和團運動後，亦為其侵占），烏蘇裏江以東至海的土地改為中俄共管。1860年中俄北京條約又將烏蘇裏江以東40萬平方公裏土地也割讓給帝俄。唯庫頁島自18世紀中葉俄日已分自南北擅自輸送囚犯或移民其地，清廷置之不問。但19世紀前期土人仍向三姓副都統（駐今黑龍江依蘭）納貢，自北京條約割棄烏蘇裏江東岸後，始斷絕關係。1875年日俄協議，俄以千島群島換日占庫頁島南部，遂占有全島。1905年日俄之戰，俄國戰敗。又割讓北緯50°以南歸日；1945年二次世界大戰日本戰敗，全島又歸蘇聯（今俄羅斯）。
19世紀沙俄侵入中亞，清朝的藩部屬國先後被占，遂即發生了中俄之間的西北邊界問題。1864年沙俄乘新疆內部戰亂，要挾清廷簽訂了“塔城條約”。1871年又乘亂強占伊犁，至1881年歸還伊犁時，又簽訂了“改訂伊犁條約”。以二約為根據，又陸續簽訂了許多分段具體界約，陸續都被割去若幹領土。最後於1884年訂立“喀什噶爾界約”，中俄西北邊界才劃定。但此約所定邊界南止於烏孜別裏山口，自此以南的帕米爾高原並未具體劃定，條約隻說自下中國界向南，俄國向西南。此後俄國又擅自占領了烏孜別裏山口以南包括東南方麵的大片帕米爾，英國也從阿富汗向北侵占了部分帕米爾。1895年英俄在倫敦訂約私分帕米爾，中國政府始終未予承認。
中印邊界上的重大變遷分東西二段。西段喜馬拉雅山以北的拉達克地區，原是西藏的一部分，首府在列城。1842年西藏地方政府和克什米爾訂約，將拉達克地區讓與克什米爾。清政府未予承認。19世紀70年代英國取得克什米爾，拉達克地區即隨同被占。東段原以喜馬拉雅山的南麓為界，門隅、洛瑜、察隅三區皆在西藏界內。終清一代沿襲不變。至民國初年，1913~1914年英國和西藏地方代表在印度西姆拉會議上搞了一個基本上以喜馬拉雅山脊為界的麥克馬洪線，未敢公開。1940年英國乘中國抗日戰爭之際，侵占了傳統邊界以北部分地區，當時中國政府曾提出抗議。1951年印度政府乘中國人民解放軍進入西藏時侵占了所有麥克馬洪線以南的地區，包括長期以來西藏地方政府設官征稅、以達旺為首府的門隅地區。