胡漢民認為王昆侖是可造就的且又有發展的所謂革命青年，在此亂世之中，自認為就要一統黨國的胡漢民十分需要像王昆侖這樣的人才，因此，他說了如下這句史有所記的話：
“不要去上海了，留在南京，先在中央黨部掛著職。”
王昆侖遵命留在了南京，但他依然不願參加自認為醜惡的派係之爭。也就是在這期間，他想到自己和範映黢雖已成為事實的夫妻，擔因所謂革命的原因，至今未舉行結婚典禮。他和範經過籌備，遂在南京補辦了一次儀禮隆重的結婚儀式。
接著，寧方——主要是胡漢民惟恐實權落在汪精衛的手裏，特委會的黨務實權力推西山會議派的人負責。這樣，王昆侖又被推選為以謝持為主任委員的組織委員會的委員兼主任秘書。實際上，王昆侖執掌了國民黨中央的組織實權。就王的本意而言，想為他理想中的黨國選配幹才，盡快地實現孫中山先生的革命遺願。但是出他所料的是，發現上當的汪精衛借口回到武漢以後，組織特委會政治分會與之對抗，並攻擊他負責主持的組織委員會違犯黨的章程，在使用幹部方麵用人唯親。由此開始，剛剛合流的寧漢雙方又變成了寧滬與漢的對立。和以往一樣，先是“文攻”，繼之又是“武鬥”。結臬，汪精衛手下的大將唐生智不敵桂係李宗仁，拱手讓出兩湖，倉皇退到廣州，想以兩廣為基地和寧滬雙方繼續角逐所謂黨國大權。對於汪精衛的失敗，王昆侖等是拍手稱快的。同時，他也越發地看透了汪精衛的人品不足道哉，不僅深埋在心的反汪的種子開始發芽，而且他還公然罵汪：
“真是一隻狐狸精，變得實在是太快了！”
正當西山會議派一一允其是王昆侖這些尚未染政客習氣的書生自鳴得意的時候，蔣介石東遊日本，在完成蔣宋聯姻之後回到了上海。蔣審時度勢，認為有聯汪（精衛）缶垮寧方的精神支柱胡漢民，遂派出自己的郎舅宋子文南下遊說。時下，汪精衛走投無路，隻好回過頭來捧蔣，因而蔣、汪一拍即合。緊接著，蔣汪暗中勾結，認為隻有打垮西山會議派，才能恢複被西山會議派所攻擊的二屆黨統。自然，二屆黨統一俟確立，桂係控製的特委會就被推翻。也隻有出現這樣的政治局麵，蔣介石才會從在野之身變為黨國的最髙主宰者。為此，他一手策劃了所謂的“一一二二”慘案。經過如下：