此時，身居重慶官拜國民政府經濟部長的翁文灝，麵對國際國內複雜的局勢與黨內黨外鉤心鬥角的人事糾葛，已感到心力交瘁、疲憊已極。盡管處於人在江湖，身不由己的官宦地位，但翁文灝還是以一個知識分子的文化良知和使命感，為“北京人”化石的命運而殫精竭慮地奔波忙碌。他收到北平發來的電報後，便與國民政府駐美大使胡適聯係，就“北京人”化石存放在美國的可行性進行了具體商談；接著，又與美國洛克菲勒基金會總部多次電函聯係，商討對策。由於局勢混亂，戰爭迫近，好不容易得到洛克菲勒基金會總部同意“北京人”化石運往美國的回音。駐美大使胡適亦表示對此竭誠相助，力保“北京人”化石赴美後的安全與主權不發生變故。由於“北京人”化石所具有的世界性聲譽，其去留關乎國家榮譽，翁文灝本人無權做主，必須得到最高當局批準方能成行。因而，他給在外視察戰事的蔣介石拍發了一封措辭激烈的電報：
介公委員長鈞鑒：
“北京人”化石在平安全可慮，有被竊遺失之危。倘遇不幸，乃為吾國與世界人類文化之一大損失。為避免可能之災難，請就遷移之去向明示為荷。
蔣介石接到電文，同樣感到左右為難，一時拿不定主意。聲名赫赫的“北京人”如同古代之九鼎，可謂鎮國之寶，古人曾言得鼎者得天下，失鼎者失天下。九鼎在國勢命運中的重要程度，從“問鼎中原”等典故中可見出分量。“北京人”所具有的世界聲譽和強大文化力量，使深知儒家正統之道和“鼎革”之運命的蔣介石也不敢貿然行事，草率地決定遷移去向，此事隻好懸而不決。待蔣介石回到重慶後，翁文灝再度催促此事，並表示：“北京人”化石危在旦夕，必須速做決定，並著手行動。否則“北京人”化石將不複見矣！蔣介石意識到此事已迫在眉睫，到了非解決不可的時候了，於是令行政院召集相關人員開會相商，自己親自到會聽取意見。經過幾番慎重討論，終於做出決定：國民政府同意並允許將“北京人”化石運往美國自然曆史博物館暫避風險，待戰爭結束後再歸還中國。