慈安暴崩以及暴崩前後留下的種種疑點，成為當朝群臣和民間百姓猜測、議論的一個神秘話題，即使在一百年後，慈安的死因仍作為清宮曆史上的一大懸案，讓研究者為此爭論不休。
那麽，東太後慈安到底是不是正常死亡？如果不屬正常死亡，又是誰謀殺了她？她的死與當時群臣公認的嫌疑者慈禧，是否有著不可言傳的關聯？
據清宮留給後世的史料看，鹹豐帝生前，已漸漸看出了慈禧的野心和恃寵驕狂的性情，意將其廢黜。聰明狡猾的慈禧聞知後，急忙拜托其妹也就是醇郡王福晉帶著皇子載淳晉見皇上，意在牽動皇上父子之情，以子憐其母，打消廢黜之念。盡管她一時達到了目的，但鹹豐對她的寵愛卻日益淡薄，甚至不再召幸她。當鹹豐逃到熱河行宮並行將歸天之際，軍機大臣肅順又冒死進諫，說懿貴妃（即慈禧）恃子而驕，居心叵測，而當今皇後忠厚老實，麗妃更非其對手，要鹹豐早為皇後和麗妃打算才好。為了說服鹹豐，肅順還列舉了曆史上的呂後、武則天等陰險刻毒的後妃相諫，暗示這個比呂後、武後毫不遜色的葉赫那拉氏，極有可能會在鹹豐駕崩之後，幹預朝政，將大清基業斷送。如果真的如此，無論是當今皇帝還是臣僚，都將愧對列祖列宗的在天之靈……鹹豐帝聽罷動了除去懿貴妃之心，欲采取斷然措施，但一向優柔寡斷的鹹豐在下定決心的最後一刻還是猶豫起來。他想起這位懿貴妃為自己生育皇子的社稷之功，又念及往昔帝妃的恩愛，不忍猝然下手。鹹豐當時還天真地想，清廷祖製甚嚴，即使她真有什麽非分之想，也不會輕易得手。正是基於這樣的考慮，鹹豐最終未采取肅順的計策，而是設計了在他看來既能保住慈禧名分，又不至讓她控製朝政的兩全之計。鹹豐帝臨終前，召肅順等顧命八大臣於榻前，命焦祐瀛代筆草擬遺詔，立六歲的皇子載淳為皇太子，命怡親王載垣、鄭親王端華和軍機大臣肅順等八大臣輔弼幼主，並讚襄一切政務。同時規定以後下達詔諭以“禦賞”“同道堂”兩方印章為信符。其中規定“禦賞”章為印起，“同道堂”章為印訖。這兩章原為鹹豐帝隨身攜帶的私章，一般不用於政治活動，但在特定場合亦可使用這兩方小印。此時鹹豐帝把它作為皇權的最高象征，分別賜給了皇後慈安和皇太子載淳，意在防範大權旁落於群臣和慈禧之手。