隨著“佛骨旋風”的狂吹猛刮，法門寺這個在地圖上無任何標記的地方，一夜之間名揚天下。迫切要求一睹奇寶異彩的人們，以及一批又一批慕名而來的海外遊客、專家考察團，紛紛通過各種渠道，向國家政府有關部門提出申請，要求參觀法門寺及其珍寶……於是，修複現代佛祖聖地的呼聲也隨之高漲起來，專家們呼籲要以法門寺地宮的發現為契機，“建設中國第一座佛教文化的專題性博物館，用現代科學技術保護、保管、展出陳列這批稀世珍寶並開展相應的學術研究和交流”。
其實，早在5月24日的新聞發布會籌備中，陝西省副省長孫達人就曾明確地要求有關部門，立即製定法門寺寺院規劃、法門寺博物館規劃和法門鎮鎮容規劃，以適應發布會後各方對瞻仰佛骨、參觀文物的強烈要求。
事實上，修建法門寺真身寶塔本屬早就進行著的正題，而中間突然發現的地宮及地宮中隱藏的珍寶，卻使這個正題一時在人們心中淡漠了、冷卻了。當“佛骨旋風”在周原以及世界刮過之後，人們才重新回頭沿著已踏開的路繼續走下去，隻是現在又多了一些題外之題。
政府的設想和專家們的提案不謀而合，修建博物館已是勢在必行。但在館址的選擇上，決策者和專家們卻發生了分歧。有人懷疑在關中西部這樣一個偏遠的小鎮上建館，不利於這批珍寶的安全，從而建議館址選在西安。有人認為從長遠的觀點看，為了開展學術研究和旅遊事業，文物盡可能不脫離其出土地點的原址，從而使器物性文物和遺址性文物有一個完美的結合，也給觀眾營造一種盡可能完整如初的曆史氛圍，並以其曆史的縱深感、文物的真實感，充分發揮曆史功能和文化價值，真正體現現代考古學的目的。
麵對兩種不同的意見，國務院專門召開會議，就法門寺出土文物保護及旅遊區的開發等問題，明確提出了“妥善保護稀世珍寶，集中反映它的曆史、科學和藝術價值，充分發揮其社會效益，就地保護和利用”的指導原則。