從上述的兩件事便可看出，朱棣雖然奪得了皇位，但是其繼位的合法性仍有待進一步加強。朱棣本來也知道這個問題，所以在進入南京城後就開始采取行動了。還是拿靖難之役來說吧，朱棣當初起兵之際曾打出“清君側，靖國難”的口號，要知道這個口號可不是一拍腦袋想出來的，這是根據姚廣孝的建議，朱棣援引朱元璋所下令編撰的《皇明祖訓》中的內容，用爺爺來壓孫子，體現自己起兵的正當性，朱元璋在位的時候曾經考慮到如果朝中出了奸臣，而天子無法製約的特殊情況，所以他《皇明祖訓》中寫道：如果朝廷中出了奸臣，而且中央已經沒有力量糾正了，這種情況下皇帝可以下密詔給各地藩王，讓他們起兵進京勤王。
朱棣當時找這麽一條理由就是隨手翻的，但當南京真的被打下來以後，朱棣發現自己這個理由中有一個漏洞。《皇明祖訓》中是規定藩王可以起兵勤王，但是有著十分嚴格的條件的，其中最重要的一條就是必須要有“天子密詔”，很顯然朱棣起兵的時候並沒有“天子密詔”，或者說他當時沒想到自己能贏，忘了偽造一份了，所以他起兵的合法性也是有漏洞的。但後來朱棣要繼位了，就得嚴謹起來了，手下的參謀發現了這個漏洞，正所謂“亡羊補牢未為晚也”，那就修補吧，於是朱棣在其即位詔書中直接將朱元璋的《皇明祖訓》給改了，去掉了起兵程序中需要的“天子密詔”這一項，也算是對自己起兵的合法性進行進一步確立了吧。
但說了這麽多，到目前為止隻是解決了起兵的合法性，但當皇帝的合法性還是沒能樹立起來啊，依然是任重道遠，所以還得接著來。
朱棣做的第一步是立人設，在朱棣進入南京城的同時，建文帝在皇宮中放了一把火。那麽朱棣趕忙派人去救火，但是晚了，人沒救到，隻發現一具焦屍，至於朱棣救火的原因和這具焦屍是不是建文帝本人，前幾章有提過，所以這裏就不多說了，反正朱棣覺得屍體就是建文帝的。這裏主要說一說朱棣之後的表現，朱棣也不怕燙、也不嫌髒，抱著焦屍就是一頓號啕大哭，一邊哭還一邊說：“你這個傻孩子怎麽這麽想不開啊，四叔來是幫你的，你這麽就做了這種傻事啊。”緊接著便下令厚葬自己這位已經燒焦了的侄子。