11世紀末，在德意誌皇帝的支持下成立的博洛尼亞大學被看作是西歐中世紀的第一所大學。1158年，德意誌皇帝弗裏德裏希一世發布敕令，允許任何人自由前往西歐各地已經建立的大學學習，給予他們司法審判權的保護。為了分散西歐各地湧向博洛尼亞大學的求學者，1224年，弗裏德裏希二世皇帝無視教皇的反對，在那波利建立一所大學。在此後的一個多世紀，西歐一些重要的政治中心或文化中心的城市中都相繼建立大學，但直到14世紀中葉，在德語地區尚沒有建立一所中世紀的大學。盡管如此，德意誌依然是西歐各地學者前來造訪之地，帝國各地經常有經院哲學各流派的論爭，科隆等城市聚集著經院哲學的大家，德意誌帝國是教權和政權爭辯的大平台。
14世紀20年代，教皇約翰內斯二十二世因插手德意誌王位之爭與路德維希四世發生公開的衝突，這個時期的著名學者奧卡姆的威廉（Wilhelm von Ockham，1288—1347）也被卷入其中。奧卡姆的威廉出生在英國一個叫奧卡姆的小鎮，很早就加入法蘭西斯修士會，後在牛津大學求學，因評注倫巴底的彼得撰寫的《教父名言集》，抨擊教會占有大量財產，提倡基督守貧等神學觀點，被牛津大學的校長斥責為異端。1323年8月，奧卡姆的威廉收到阿維尼翁教廷的傳訊，前往教廷為自己進行申辯。此時，教皇約翰內斯二十二世與法蘭西斯修士會的切塞納的米夏埃爾（Michaelvon Cesena，1270—1342）也針對基督守貧等教義問題進行激烈的爭論，威廉因支持米夏埃爾的觀點受到牽連與其一起被囚禁在阿維尼翁。1328年5月26日，奧卡姆的威廉和切塞納的米夏埃爾以及法蘭西斯修士會的修士一起逃出阿維尼翁，他們在比薩偶遇德意誌皇帝路德維希四世。被約翰內斯二十二世宣布絕罰的路德維希四世立刻將這一行人置於自己的保護之下。1330年初，奧卡姆的威廉以及與他一同逃出阿維尼翁的同行者跟隨路德維希四世到了慕尼黑，他長居那裏直至終老。在慕尼黑，威廉撰寫了很多有關教皇權限以及教權和政權關係的論著，他在《關於皇帝和教皇權力的對話》中，立場鮮明地維護皇權的權威，提倡廢除樞機主教選舉教皇的製度，改為由宗教會議選舉教皇，反對教皇享有絕對的權力。後人用“你用劍保護我，我用筆保護你”這句話恰當地描述出了威廉與路德維希四世之間的關係。