南京臨時政府的一大課題是爭取日本與歐美列強的承認。下麵就以此為中心，結合各省軍政府與日本關係等其他問題，闡述南京臨時政府與日本政府、軍部及民間的相互關係。
南京臨時政府是在南方諸省軍政府的基礎上成立的。因此，在論及南京臨時政府之前，應當先考察南方諸省軍政府與日本的關係。這是後來南京臨時政府與日本發生關係的序曲，南京臨時政府與日本的關係是這一關係的繼續和發展。
武昌起義後建立的第一個革命政權是湖北軍政府。湖北軍政府籌劃成立統一的中央臨時政府時，希望日本承認這一政權。11月13日，湖北省都督黎元洪作為中華民國中央政府的代表向駐漢口總領事鬆村提出：“今後與貴國交涉的事件中，凡與中華民國全局有關之事，必須都與本都督協議”，並對即將成立的統一的中央政府希望“貴國政府予以承認”[2]，作為承認的代價，黎元洪認可武昌起義前清朝政府與各國締結的不平等條約及一切借款契約繼續生效；但起義後各國與清政府的借款和條約，無論任何一個國家，都一概不予承認。[3]黎對日的這一要求和希望，一是想得到日本對新政權的支持，二是牽製日本對清政府的援助，進而在外交上孤立清政府。
以湖北省為首的南方諸省相繼獨立後，日本應該先承認其為交戰團體，但日本卻沒有這樣做。日本隻是默認其存在，與其進行有條件的往來和交涉。11月25日，內田外相就黎的要求指示鬆村：“在革命軍事實上行使權力的情況下，與它不得不進行各種交涉；今後有必要時，與革命軍進行適當交涉也可”，“如革命軍主張作為交戰者所擁有的權利……則我方由此不受實質性損失情況下可以默認其權利”。[4]默認交戰者的權利，就意味著默認其為交戰團體。但默認和承認則不同。按國際法，日本應該承認其為交戰團體，以此保護其管轄地域內的日本權益。但日本為了維護革命軍占領區內的日本權益，隻是默認其存在，外交上與其往來。