農業
德川幕府結束戰國時代以來的兵亂，完成了國家的統一，勞動人民在較安定的環境裏進行生產。幕藩為鞏固其建立在小農經濟基礎上的封建統治，保證貢賦的收入，竭力扶植自耕農（本百姓）的發展，抑製土豪地主富農的勢力，除嚴禁土地永世買賣及分田給子孫外，還采取禁止人身買賣和使用家奴，允許農民控告領主乃至移住其他領地等措施。又多次令禁農民逃亡，防止土地荒廢。慶安三年（1650），幕府向全國農民發布了《慶安告諭》，對農民的生產和生活提出了32條嚴格限製，包括幹涉農民種植經濟作物，要求每人衣食住行極端節約。盡管這樣苛刻的限製，商品經濟仍在全國逐漸發展，出現了商業性農業，生產力也在提高。萬治三年（1660）發明腳踏水車，17世紀末，開始使用2至4個齒的“備中鎬”，不靠畜力也能深耕。還發明和普及了“千齒脫粒器”（千齒扱），比舊時竹製或鐵製的“脫粒筷子”提高效率2至10倍。[126]不久，又發明篩穀用的“千石篩”（千斛簁）。肥料方麵，除傳統的草肥、堆肥、灰肥、廄肥及糞尿等自然肥料外，農民還購用油渣、幹燥魚肥等肥田。為消滅蟲害，已開始使用鯨油、石灰作除蟲劑。栽培技術也有提高，如選擇病蟲害較少的稻種，實行輪種法和雙季稻栽培等。17世紀初期，出現了日本最早的農書《清良記》，以後陸續出版了《百姓傳記》（1682）、《會津農書》（1690）等。元祿九年（1696），宮崎安貞參考中國《農政全書》和本草書，並總結日本農民的生產經驗，出版了《農業全書》，使先進技術廣為傳播。[127]德川時代成為近代以前日本農學最發展的時期，基於上述原因，單位麵積產量有了提高。每一反稻米產量，1594年上等水田平均為1石3鬥，到1686年則為1石5鬥了。[128]