藥師如來法門大略，如大藥師寺已印行之藥師如來法門略錄所載。
今所述者，為吾人平常修持簡單之課儀。若正式供養法，乃至以五色縷結藥叉神將名字法等，將來擬別輯一卷專載其事，今不述及。
欲修持藥師如來法門者，應供藥師如來像。上海佛學書局有石印彩色之像，可以供奉，宜裝入玻璃鏡中。供像之處，不可在臥室。若不得已，在臥室中供奉者，睡眠之時，宜以淨布覆蓋像上。
藥師經，供於幾上。不讀誦時，宜以淨布覆蓋。
供佛像之室內，須十分潔淨，每日宜掃地，並常常拂拭幾案。
供佛之香，須擇上等有香氣者。
供佛之花，須擇開放圓滿者，若稍殘萎，即除去。花瓶之水，宜每日更換。若無鮮花時，可用紙製者代之。
此外如供淨水供食物等，隨各人意。但所供食物，須人可食者乃供之，若未熟之水果及未烹調之蔬菜等皆不可供。
以上所舉之供物，應於禮佛之前預先供好。凡在佛前供物或禮佛時，必須先洗手漱口。此外如能懸幡燃燈尤善，無者亦可。以下略述修持課儀，分為七門。其中禮敬、讚歎、供養及回向發願，必須行之。誦經持名持咒，可隨己意，或惟修二法，或僅修一法，皆可。
一.禮敬
十方三寶一拜，或分禮佛、法、僧三拜。本師釋迦牟尼佛一拜。藥師琉璃光如來三拜。此外若欲多拜，或兼禮敬其他佛菩薩者，隨己意增加。
禮敬之時，須至誠恭敬，緩緩拜起。萬不可匆忙。寧可少拜，不可草率。
二.讚歎
禮敬既畢，於佛前長跪合掌，唱讚偈雲：
歸命滿月界，淨妙琉璃尊，
法藥救人天，因中十二願，
慈悲弘誓廣，願度諸含生，
我今申讚揚，誌心頭麵禮。
上讚偈出藥師如來消災除難念誦儀軌。唱讚之時，聲宜遲緩，宜莊重。