一.藥師法門依據藥師經而建立。此土所譯藥師經有四種：
（一）佛說灌頂拔除過罪生死得脫經一卷，即大灌頂神咒經卷十二，東晉帛屍梨蜜多羅譯。又相傳有劉宋慧簡譯藥師琉璃光經一卷，今已遺失，或雲即是東晉所譯之灌頂經。
（二）佛說藥師如來本願經一卷，隋達摩笈多譯。
（三）藥師琉璃光如來本願功德經一卷，唐玄奘譯。此即現今流通本所據之譯本。現今流通本與原譯本稍有不同者有增文兩段，一為依東晉譯本補入之八大菩薩名，二為依唐義淨譯本補入神咒及前後文二十餘行。
（四）藥師琉璃光七佛本願功德經二卷，唐義淨譯。前數譯惟述藥師佛，此譯複增六佛，故雲七佛本願功德經，此後增加之文甚多。西藏僧眾所讀誦者為此本。
二.修持之法具如經文所載，今且舉四種如下：
（一）持名：經中屢雲聞名、持名，因其法最為簡易，其所獲之益亦最為廣大也。今人持名者，皆曰消災延壽藥師佛似未盡善，佛名惟舉藥師二字未能具足。佛德惟舉消災延壽四字亦多所缺略，故須依據經文，而曰藥師琉璃光如來斯為最瑤善矣。
（二）供養：如香華幡燈等。
（三）誦經：如演說開示書寫等。
（四）持咒：所獲利益廣如經文所載，今且舉十種如下：
1.速得成佛，經中屢言之。
2.行邪道者令入正道，行小乘者令入大乘。
3.能得種種戒，又犯戒者還得清淨不墮惡趣。
4.得長壽富饒官位男女等。
5.得無盡，所受用物無所乏少。
6.一切痛苦皆除，水火刀兵盜賊刑戮諸災難等悉免。
7.轉女成男。
8.產時無苦，生子聰明少病。
9.命終後隨其所願往生：
（1）人中，得大富貴。
（2）天上，不複更生諸惡趣。