蘇格蘭也成了新教國家，但是年輕漂亮的蘇格蘭女王瑪麗仍然是一個天主教徒。瑪麗女王在法國長大，嫁給了年輕的法國國王弗朗索瓦二世。在伊麗莎白成為英格蘭女王後不久，瑪麗就回到了蘇格蘭，但是那些信奉新教的蘇格蘭貴族都反對她。
瑪麗女王做了一些愚蠢的事，從而使敵人有機會來傷害她。瑪麗女王被關在洛克利文城堡裏，在一個年輕侍從的幫助下逃了出來。天主教貴族幫助她與敵人作戰，卻戰敗了，之後，她便逃到了英格蘭，希望伊麗莎白女王能夠幫助自己。
伊麗莎白一直非常嫉妒瑪麗，因為她長得太漂亮了。美麗的金黃色頭發，皮膚白皙，眼睛是可愛的棕色，非常的優雅迷人。伊麗莎白長得並不像瑪麗那麽漂亮，這是她一直不喜歡瑪麗的原因。她把瑪麗扔進監獄關了好多年。
英格蘭的天主教徒認為瑪麗比伊麗莎白更有資格繼承英格蘭王位，其中一些人密謀殺死伊麗莎白，試圖讓瑪麗成為英格蘭女王。結果陰謀被伊麗莎白發現，策劃者被處死。伊麗莎白說瑪麗也知道這個陰謀，於是就判處她死刑。
當瑪麗女王穿著深紅色的衣服走到佛斯裏亨城堡的大廳將要被處死時，就像一個老太婆一樣。她在監獄裏度過了漫長的歲月，金發已經變白了。但是她仍然很漂亮，臨死時還安慰那些在她身邊傷心哭泣的女人。
蘇格蘭新教徒並不屬於路德派，他們是法國宗教改革家約翰·加爾文的追隨者。當新教改革者剛剛出現在法國的時候，國王弗朗索瓦一世就迫害他們，他死後，繼任的法國國王繼續迫害新教改革者，因為法國一直都是天主教國家。但法國始終存在新教徒，後麵我們會看到，新教徒在法國遭受的苦難比在其他任何國家都要可怕。
約翰·加爾文是法國早期的新教徒之一，他逃到了瑞士，並在那裏成為最有影響力的新教領袖之一。瑞士幾乎完全變成了新教國家，但少數地方仍然保留著天主教。日內瓦以前由一個主教統治，現在這座城市被交給了加爾文。他用自己的方式統治著日內瓦，來自歐洲各地的新教徒都到日內瓦聆聽他的教導。